More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0651 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
249 aa  497  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0613  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
249 aa  497  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3733  ABC transporter related  92.37 
 
 
249 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  76.71 
 
 
254 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  75.9 
 
 
254 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  75.5 
 
 
254 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  55.65 
 
 
254 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  56.05 
 
 
254 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  52.24 
 
 
251 aa  244  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  50.2 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.23 
 
 
247 aa  231  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  49.18 
 
 
253 aa  231  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  48.8 
 
 
261 aa  229  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  49.58 
 
 
257 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  49.58 
 
 
257 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  48.75 
 
 
257 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  46.75 
 
 
253 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  46.5 
 
 
265 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.41 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  45.93 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  45.56 
 
 
250 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  46.03 
 
 
250 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  45.24 
 
 
250 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  44.44 
 
 
263 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  45.24 
 
 
250 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  43.8 
 
 
251 aa  194  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  43.2 
 
 
251 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 
256 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  43.39 
 
 
250 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  40.73 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1243  ABC transporter related  43.27 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  41.53 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
271 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  42.04 
 
 
246 aa  181  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  39.92 
 
 
249 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  39.76 
 
 
250 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  40.8 
 
 
249 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  43.27 
 
 
259 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  43.95 
 
 
249 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  42.45 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  37.65 
 
 
251 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  39.84 
 
 
251 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  38.71 
 
 
249 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  45.31 
 
 
594 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 
249 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  44.67 
 
 
594 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.9 
 
 
594 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  45.31 
 
 
594 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  40 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  39.68 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  39.18 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  41.35 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.67 
 
 
594 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  44.9 
 
 
594 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  37.04 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  39.02 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  38.78 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
256 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  44.9 
 
 
594 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
256 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  40.4 
 
 
250 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  45.31 
 
 
594 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  44.9 
 
 
594 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  41.63 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  40.24 
 
 
252 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  40 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  40.5 
 
 
250 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  42.13 
 
 
255 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  40.91 
 
 
251 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  38.8 
 
 
255 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
250 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  42.45 
 
 
250 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  41.06 
 
 
254 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  42.45 
 
 
250 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.53 
 
 
594 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.53 
 
 
594 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  44.53 
 
 
594 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  44.53 
 
 
594 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.53 
 
 
594 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.53 
 
 
594 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.53 
 
 
594 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.08 
 
 
254 aa  169  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  40.32 
 
 
840 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  42.8 
 
 
608 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  39.44 
 
 
258 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  36.78 
 
 
259 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  42.8 
 
 
608 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  36.59 
 
 
257 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  37.96 
 
 
254 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
250 aa  168  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  40.33 
 
 
840 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  38.61 
 
 
257 aa  168  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 
257 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  37.94 
 
 
255 aa  167  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0854  ABC transporter related  40 
 
 
250 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.690377  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  36.33 
 
 
262 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 
257 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>