More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4046 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  59.84 
 
 
250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  57.72 
 
 
264 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  55.02 
 
 
249 aa  277  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  55.69 
 
 
250 aa  276  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  56.85 
 
 
251 aa  274  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.82 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  55.02 
 
 
251 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  59.18 
 
 
255 aa  258  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  56 
 
 
250 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  56.91 
 
 
249 aa  245  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  52.44 
 
 
246 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  56.28 
 
 
250 aa  245  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  51.19 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  49.19 
 
 
250 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  52.4 
 
 
256 aa  234  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  47.77 
 
 
258 aa  232  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  49.19 
 
 
256 aa  230  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  49 
 
 
252 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  51.02 
 
 
251 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  49.19 
 
 
256 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  48.59 
 
 
254 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
248 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  46.56 
 
 
257 aa  228  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 
250 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  48.57 
 
 
251 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  47.56 
 
 
245 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  44.58 
 
 
249 aa  221  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  48.77 
 
 
252 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 
250 aa  221  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  45.67 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  48.81 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  48.19 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  44 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 
250 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  42.17 
 
 
250 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  42.17 
 
 
251 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  45.56 
 
 
258 aa  214  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  47.39 
 
 
254 aa  214  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  47.13 
 
 
257 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  48.97 
 
 
256 aa  211  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  47.39 
 
 
250 aa  211  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
251 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
271 aa  210  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  43.15 
 
 
253 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  46.4 
 
 
249 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  45.91 
 
 
257 aa  208  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  44.18 
 
 
250 aa  207  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  46.03 
 
 
272 aa  207  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  46.34 
 
 
282 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  43.95 
 
 
250 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  44.26 
 
 
251 aa  204  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  43.15 
 
 
255 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  43.87 
 
 
256 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  44.13 
 
 
250 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  42.13 
 
 
256 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  45.08 
 
 
257 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  46.77 
 
 
259 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  42.57 
 
 
250 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  45.02 
 
 
266 aa  201  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 
249 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  44.98 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  42.97 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  46.77 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  45.08 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  37.96 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  43.85 
 
 
859 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  44.35 
 
 
254 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  43.32 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  42.86 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 
257 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.95 
 
 
254 aa  198  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  41.53 
 
 
253 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  42.45 
 
 
259 aa  198  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 
257 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  42.28 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  40.73 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  40.73 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  45.67 
 
 
597 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  47.01 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  48.57 
 
 
249 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  47.97 
 
 
260 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  45.56 
 
 
594 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  43.55 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  42.68 
 
 
254 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  41.94 
 
 
251 aa  195  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  43.5 
 
 
261 aa  195  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  42.34 
 
 
266 aa  195  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  43.5 
 
 
262 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  41.8 
 
 
261 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  41.53 
 
 
256 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  40.73 
 
 
254 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  42.8 
 
 
252 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  42.68 
 
 
262 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  46.09 
 
 
252 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  40 
 
 
249 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>