More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5130 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  59.84 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  60.08 
 
 		 249 aa  299  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  63.67 
 
 		 255 aa  298  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  59.68 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  56.97 
 
 		 264 aa  295  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  58.61 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  58 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.03 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  60.08 
 
 		 249 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  59.35 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  57.96 
 
 		 250 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  50.81 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  52.87 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  51.44 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  50.81 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  241  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  50.2 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  49 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  50.41 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  46.43 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  50.41 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  52.02 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  48.8 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  47.37 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  49.2 
 
 		 250 aa  228  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  45.75 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  45.08 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  48 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  54.07 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  48.58 
 
 		 256 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  47.58 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  47.77 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  47.77 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  50.6 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  46.72 
 
 		 859 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  49 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  47.76 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  45.08 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  47.76 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  47.6 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  44.86 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  47.76 
 
 		 253 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  48.36 
 
 		 248 aa  214  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  46.53 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  45.34 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  44.44 
 
 		 258 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.34 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  42.34 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  42.34 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  46.31 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  43.9 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  44.13 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  42.97 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  43.5 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  42.62 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  45.68 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  43.55 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  43.39 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  45.27 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  42.62 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  41.9 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  43.55 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  41.9 
 
 		 255 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  41.9 
 
 		 255 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  43.55 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  44.67 
 
 		 842 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  40.8 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  46.34 
 
 		 249 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  44.03 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.49 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.4 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  41.87 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  41.94 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  45.08 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  42.98 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  45.87 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  42.68 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  44.03 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  44.81 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  42.57 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  46.69 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  44.81 
 
 		 262 aa  198  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  41.87 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  42.15 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  41.2 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  42.74 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  43.62 
 
 		 278 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  42.56 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  42.15 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>