More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5725 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  510  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  510  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  99.61 
 
 		 255 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  85.49 
 
 		 255 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  85.49 
 
 		 255 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  74.02 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  75.49 
 
 		 256 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  75.2 
 
 		 259 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  75.49 
 
 		 256 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  74.8 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  75.59 
 
 		 255 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  73.71 
 
 		 257 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  60.32 
 
 		 255 aa  295  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  58.06 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.66 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  57.66 
 
 		 250 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  55.28 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  59.84 
 
 		 273 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  44.8 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  46.31 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  43.43 
 
 		 255 aa  207  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  42.34 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  43.15 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  45.71 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  45.56 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  41.9 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  45.71 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  45.31 
 
 		 253 aa  201  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.13 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  41.22 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  41.53 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  41.13 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  41.53 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  44.9 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  43.72 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.57 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.27 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  40.64 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.57 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  41.43 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  41.43 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  40.98 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  42.34 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  46.34 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  40.98 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  41.27 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  41.27 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  41.27 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  41.27 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  41.39 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  46.56 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  43.16 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  42.62 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  43.08 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  43.92 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  40.96 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  38.76 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  41.37 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  43.08 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  42.68 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.62 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  40.74 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1253  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.09 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  39.44 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  41.57 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  40.16 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  43.21 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  40.16 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.77 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.17 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.53 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  40.87 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  39.43 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  40.57 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  40.73 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  39.09 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  40.57 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  39.51 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  41.39 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  43.67 
 
 		 253 aa  188  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  38.65 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>