More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1332 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  510  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  86.29 
 
 		 255 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  64.2 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  64.78 
 
 		 252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  64.88 
 
 		 282 aa  297  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  63.71 
 
 		 245 aa  293  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  64.08 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  58.3 
 
 		 250 aa  275  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  57.09 
 
 		 254 aa  271  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  55.78 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  57.49 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  56.47 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  57.83 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  55.47 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  53.04 
 
 		 257 aa  251  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  52.03 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  48.76 
 
 		 594 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  49.58 
 
 		 597 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  53.88 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  50.81 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  49.4 
 
 		 252 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  51.01 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  47.35 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  47.18 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  48.81 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  48.19 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  46.15 
 
 		 250 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  47.18 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  47.18 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  47.6 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  51.6 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  45.78 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  48.59 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  46.94 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  47.01 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  49.01 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  50.2 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  43.43 
 
 		 255 aa  208  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 266 aa  208  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  43.15 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  41.92 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  44 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  44 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  43.15 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  43.15 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  42.74 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  46.72 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  42.91 
 
 		 625 aa  204  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  46 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.74 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  47.35 
 
 		 249 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  43.78 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  47.37 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  47.58 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  44 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  44.44 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  43.2 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  47.39 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  44.9 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  43.55 
 
 		 251 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  42.13 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  44.05 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  42.34 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  43.7 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  42.91 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  39.76 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  44.49 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  43.85 
 
 		 246 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  43.72 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0501  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.18 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  46.99 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.28 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  44.08 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  42.34 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  43.43 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  46.06 
 
 		 484 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  42.17 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  41.53 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.62 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  41.18 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  42.8 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  39.92 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  45.12 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  42.4 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  41.37 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  45.87 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  41.3 
 
 		 842 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  39.76 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>