More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0633 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  58.13 
 
 
264 aa  275  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  61.89 
 
 
251 aa  265  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  53.28 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  60.57 
 
 
249 aa  248  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  50.6 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  50.2 
 
 
251 aa  234  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  49.8 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  50.41 
 
 
248 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  55.73 
 
 
255 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  50.61 
 
 
248 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 
256 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  48.4 
 
 
250 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  49.39 
 
 
252 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  46.43 
 
 
253 aa  224  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  47.18 
 
 
251 aa  224  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  48.77 
 
 
251 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  47.88 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  47.18 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  46.4 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  47.98 
 
 
250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  46.18 
 
 
254 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  47.01 
 
 
251 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  46.61 
 
 
245 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  47.98 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  47.72 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  48.78 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  48.1 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  44.72 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  46.8 
 
 
852 aa  211  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  46.47 
 
 
252 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 
250 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  49.18 
 
 
250 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  47.37 
 
 
594 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  45.64 
 
 
252 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  43.08 
 
 
840 aa  208  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  46.72 
 
 
246 aa  208  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 
250 aa  207  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  45.9 
 
 
257 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  42.21 
 
 
257 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  46.99 
 
 
255 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  49.2 
 
 
254 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  47.39 
 
 
255 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  42.62 
 
 
258 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  42.97 
 
 
257 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  44.58 
 
 
249 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  47.93 
 
 
233 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  44.77 
 
 
249 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  43.98 
 
 
256 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  43.44 
 
 
257 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  45.56 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  48.79 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  42.91 
 
 
863 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  43.98 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  40.43 
 
 
840 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  43.75 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  43.44 
 
 
257 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  42.68 
 
 
838 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2762  ABC transporter related  43.15 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  44.58 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  43.85 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  44.03 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3132  ABC transporter related  43.15 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0678345  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 
250 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  42.74 
 
 
266 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  41.2 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  41.34 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  42.56 
 
 
840 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  42.04 
 
 
859 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  45.02 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  44.26 
 
 
597 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  44.31 
 
 
255 aa  195  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.42 
 
 
254 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  41.87 
 
 
256 aa  195  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  41.25 
 
 
254 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 
248 aa  194  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  42.5 
 
 
262 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  42.5 
 
 
257 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  42.86 
 
 
250 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  43.75 
 
 
251 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  44.72 
 
 
254 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  41.22 
 
 
286 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  38.71 
 
 
255 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3827  ABC transporter related  41.91 
 
 
256 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  41.06 
 
 
249 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  45.87 
 
 
233 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  42.06 
 
 
255 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  40.49 
 
 
255 aa  192  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.87 
 
 
233 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  40.77 
 
 
259 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.55 
 
 
255 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.96 
 
 
255 aa  191  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  41.94 
 
 
266 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  41.22 
 
 
842 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  44.18 
 
 
292 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.57 
 
 
255 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.68 
 
 
250 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>