More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0211 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  100 
 
 
245 aa  501  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  84.08 
 
 
282 aa  407  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  79.59 
 
 
258 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  67.21 
 
 
252 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  68.31 
 
 
248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  63.37 
 
 
255 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  63.71 
 
 
255 aa  293  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  56.38 
 
 
251 aa  275  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  57.94 
 
 
257 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  53.09 
 
 
258 aa  266  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  54.55 
 
 
257 aa  265  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  57.38 
 
 
250 aa  262  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  55.02 
 
 
253 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  56.15 
 
 
254 aa  258  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  56.56 
 
 
250 aa  258  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  51.85 
 
 
252 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  50.2 
 
 
252 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  45.57 
 
 
250 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.9 
 
 
256 aa  224  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  47.56 
 
 
251 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  48.15 
 
 
251 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  48.15 
 
 
249 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 
248 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  49.79 
 
 
249 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  50 
 
 
255 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  49.58 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  47.33 
 
 
264 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  49.79 
 
 
250 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  45.68 
 
 
251 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  45.71 
 
 
250 aa  218  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  45.19 
 
 
249 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  44.86 
 
 
250 aa  215  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  46.91 
 
 
597 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  46.25 
 
 
594 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  47.06 
 
 
250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  43.9 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  42.92 
 
 
253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  42.8 
 
 
252 aa  199  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  42.62 
 
 
250 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  44.86 
 
 
249 aa  198  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  40.96 
 
 
271 aa  198  7e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  45.71 
 
 
250 aa  198  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  46.61 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  42.98 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  42.92 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  42.98 
 
 
273 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  43.39 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 
251 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  41.95 
 
 
255 aa  192  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  42.35 
 
 
260 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  43.51 
 
 
251 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  42.8 
 
 
254 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  37.4 
 
 
266 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  41.8 
 
 
259 aa  191  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  42.4 
 
 
254 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  39.67 
 
 
263 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  40.56 
 
 
268 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  41.8 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  41.8 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 
257 aa  188  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  40.93 
 
 
250 aa  188  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  40.65 
 
 
266 aa  188  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  44.4 
 
 
484 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  43.25 
 
 
256 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  47.48 
 
 
250 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  42.34 
 
 
260 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  38.68 
 
 
256 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  38.27 
 
 
256 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  41.88 
 
 
272 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  42.51 
 
 
840 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  38.87 
 
 
256 aa  185  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  41.6 
 
 
254 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 
257 aa  185  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  40.82 
 
 
256 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  39.09 
 
 
278 aa  185  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  41.56 
 
 
256 aa  185  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  41.56 
 
 
256 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  41.6 
 
 
254 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 
257 aa  184  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 
257 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  38.93 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  39.92 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  41.74 
 
 
251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.68 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  39.09 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  46.38 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  39.68 
 
 
504 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 
257 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  41.6 
 
 
256 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  39.27 
 
 
255 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 
250 aa  182  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  39.27 
 
 
255 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  42.56 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.95 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  41.88 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  39.27 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  40.59 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>