More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2718 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  100 
 
 
233 aa  454  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  91.42 
 
 
233 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  90.99 
 
 
233 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  45.9 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  45.9 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  45.9 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  44.49 
 
 
255 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  48.36 
 
 
250 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  47.13 
 
 
259 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  47.54 
 
 
252 aa  204  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.67 
 
 
255 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  45.27 
 
 
255 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  47.11 
 
 
250 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  48.97 
 
 
251 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  52.48 
 
 
249 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  46.72 
 
 
256 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  46.72 
 
 
256 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  48.13 
 
 
256 aa  201  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  44.67 
 
 
259 aa  201  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  45.53 
 
 
252 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  48.76 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  46.06 
 
 
252 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  45.31 
 
 
256 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  44.26 
 
 
257 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  48.13 
 
 
257 aa  198  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  45.87 
 
 
246 aa  197  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  44.9 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.76 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  44.67 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  51.03 
 
 
255 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 
256 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  47.3 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1253  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.45 
 
 
244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  46.06 
 
 
257 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  45.9 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  49.17 
 
 
264 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  46.12 
 
 
251 aa  194  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.21 
 
 
250 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  46.69 
 
 
249 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  46.06 
 
 
257 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  43.21 
 
 
250 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  44.4 
 
 
256 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  44.4 
 
 
256 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  43.21 
 
 
251 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  45.27 
 
 
258 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  45.45 
 
 
250 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  44.49 
 
 
251 aa  191  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  45.87 
 
 
255 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  43.78 
 
 
246 aa  191  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  43.95 
 
 
266 aa  191  9e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  45.87 
 
 
250 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  46.28 
 
 
255 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  45.42 
 
 
272 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  44.03 
 
 
250 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  45.12 
 
 
254 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  42.8 
 
 
255 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  44.44 
 
 
255 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  43.62 
 
 
250 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  50.62 
 
 
250 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  46.75 
 
 
608 aa  188  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  41.87 
 
 
253 aa  187  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  46.15 
 
 
272 aa  187  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  43.85 
 
 
255 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  44.21 
 
 
254 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  44.63 
 
 
859 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  45.68 
 
 
248 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 
254 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  39.92 
 
 
253 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  48.13 
 
 
260 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  46.84 
 
 
505 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  42.56 
 
 
260 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  41.63 
 
 
258 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  44.63 
 
 
250 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  44.81 
 
 
252 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  44.63 
 
 
250 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.9 
 
 
254 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  48.76 
 
 
251 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
271 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
250 aa  185  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  43.5 
 
 
254 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 
251 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  45.19 
 
 
245 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  43.39 
 
 
842 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  43.9 
 
 
254 aa  184  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  45.27 
 
 
250 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  43.9 
 
 
254 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  43.9 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  46.31 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3319  ABC transporter related  47.21 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.23 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  44 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  44.44 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  43.4 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  41.74 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  41.74 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
250 aa  182  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>