More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0363 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  61.41 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  65.86 
 
 		 249 aa  291  9e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  54.88 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  61.89 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  52.87 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  53.28 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.84 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  53.14 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  56.1 
 
 		 255 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  51.02 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  50.81 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  50.82 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  48.55 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  47.35 
 
 		 252 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  46.37 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  47.58 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  46.53 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  47.18 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  45.49 
 
 		 254 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  45.56 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  47.33 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  43.8 
 
 		 257 aa  214  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  46.25 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  44.67 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  49.38 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  46.53 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  42.34 
 
 		 258 aa  211  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  49.8 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  46.41 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  47.11 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.15 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  45.99 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  43.25 
 
 		 257 aa  207  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  43.39 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  45.42 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  43.75 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  46.53 
 
 		 272 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  42.8 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  42.91 
 
 		 251 aa  204  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  45.27 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.18 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  48.16 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  45.53 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  45.53 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  45.12 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  42.17 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  45.87 
 
 		 597 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.19 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.37 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  45.53 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  46.09 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  44.31 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  44.63 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.8 
 
 		 264 aa  198  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 251 aa  197  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  43.2 
 
 		 840 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  42.46 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  41.98 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  45.04 
 
 		 594 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  45.12 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  44.21 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  43.8 
 
 		 282 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  41.73 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  46.09 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42.8 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.97 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.97 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  42.34 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  42.17 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  41.73 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  42.62 
 
 		 258 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  45.23 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  45.68 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.29 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  43.8 
 
 		 249 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  43.85 
 
 		 252 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  48.41 
 
 		 262 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  44.26 
 
 		 250 aa  194  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  49.15 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.75 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  43.9 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  40.73 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  41.15 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  43.51 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  45.9 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.9 
 
 		 233 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  41.67 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.44 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.43 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  46.31 
 
 		 233 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.15 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  41.43 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.43 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>