More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1384 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1401  ABC transporter related  77.11 
 
 
252 aa  388  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  0.617202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  72.29 
 
 
251 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2762  ABC transporter related  59.2 
 
 
256 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  59.2 
 
 
256 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3132  ABC transporter related  58.4 
 
 
256 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0678345  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  58.4 
 
 
256 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3827  ABC transporter related  57.6 
 
 
256 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.82 
 
 
264 aa  209  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.43 
 
 
265 aa  208  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  43.15 
 
 
249 aa  204  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  43.5 
 
 
252 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  41.67 
 
 
271 aa  198  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  42.15 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  42.15 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  41.7 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  41.77 
 
 
251 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.64 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
250 aa  195  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.09 
 
 
255 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.19 
 
 
256 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.09 
 
 
255 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  40.49 
 
 
268 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  42.23 
 
 
260 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
250 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  42.23 
 
 
260 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  38.21 
 
 
249 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  38.65 
 
 
259 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  39.18 
 
 
259 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  40.82 
 
 
250 aa  192  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  39.37 
 
 
255 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.09 
 
 
255 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  41.3 
 
 
250 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  38.21 
 
 
249 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  42.23 
 
 
260 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  41.53 
 
 
258 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  38.8 
 
 
254 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  38.65 
 
 
268 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  41.53 
 
 
258 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  41.53 
 
 
258 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  41.53 
 
 
258 aa  191  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  38.21 
 
 
249 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.32 
 
 
254 aa  191  8e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  41.11 
 
 
257 aa  191  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  40.24 
 
 
259 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
254 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  38.8 
 
 
254 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  40.24 
 
 
625 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  38.4 
 
 
250 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  39.84 
 
 
264 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.04 
 
 
255 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.04 
 
 
255 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  41.09 
 
 
262 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  40.49 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  42.23 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  40.08 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  42.28 
 
 
256 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  40.73 
 
 
258 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.73 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  42.23 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  38.65 
 
 
269 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  40.56 
 
 
250 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  40.49 
 
 
246 aa  188  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  39.92 
 
 
259 aa  188  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  38.37 
 
 
257 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  38.15 
 
 
250 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  40.73 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  40.65 
 
 
250 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  41.27 
 
 
257 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.74 
 
 
269 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  38.91 
 
 
255 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  38.37 
 
 
262 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6490  ABC transporter related  41.08 
 
 
244 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  41.13 
 
 
256 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  39.53 
 
 
255 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  41.02 
 
 
257 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.65 
 
 
255 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  37.96 
 
 
266 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  41.02 
 
 
257 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  37.69 
 
 
255 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
256 aa  186  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  36.73 
 
 
266 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  39.76 
 
 
256 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  40.32 
 
 
255 aa  185  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  36.94 
 
 
284 aa  185  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  39.76 
 
 
265 aa  185  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  39.92 
 
 
255 aa  185  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  38.58 
 
 
252 aa  185  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.25 
 
 
255 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  41.53 
 
 
261 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  39.04 
 
 
255 aa  185  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  41.83 
 
 
256 aa  184  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  38.31 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  40.73 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  41.13 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  37.11 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  40.15 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  38.62 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  39.29 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  37.6 
 
 
536 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>