More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4368 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  92.06 
 
 		 252 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  55.69 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  56.1 
 
 		 254 aa  268  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  56.1 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  54 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  52.73 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  53.39 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  50.2 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  52.38 
 
 		 252 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  51.85 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  50.2 
 
 		 245 aa  244  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  49.19 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  49.59 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  53.11 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  48.77 
 
 		 597 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  49.4 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  46.91 
 
 		 594 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  47.33 
 
 		 250 aa  222  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  49.39 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  48.96 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  48.35 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  44.81 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  44.44 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  45.53 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  44.72 
 
 		 621 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  47.28 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  46.53 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  46.28 
 
 		 840 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  43.9 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  45.02 
 
 		 863 aa  205  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  43.72 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  47.11 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  44.22 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  42.86 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  45.27 
 
 		 249 aa  201  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  44.87 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  42.68 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.53 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  44.13 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  48.35 
 
 		 852 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  44.87 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  46.69 
 
 		 484 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  43.72 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  43.78 
 
 		 859 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  44.02 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  45.53 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  44.49 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  43.72 
 
 		 840 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  47.6 
 
 		 250 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  45.27 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  42.74 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  45.64 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  45.04 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  45.02 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  44.12 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.55 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  42.98 
 
 		 838 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  47.15 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  45.53 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  41.43 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  42.57 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  41.83 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  44.35 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  42.8 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 257 aa  187  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  40.4 
 
 		 251 aa  187  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  41.8 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  43.21 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  37.86 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  42.51 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  39.76 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  42.29 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  40.57 
 
 		 840 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  43.78 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.86 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.86 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  41.74 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  40.82 
 
 		 277 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  42.56 
 
 		 271 aa  184  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  40.4 
 
 		 266 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  42.02 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  41.87 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  45.11 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  41.06 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  43.03 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  41.63 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>