More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3132 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  70.56 
 
 
257 aa  360  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  70.56 
 
 
258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  59.44 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  58.63 
 
 
250 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  57.66 
 
 
254 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  58.17 
 
 
252 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  57.54 
 
 
253 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  56.38 
 
 
245 aa  275  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  57.83 
 
 
255 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  57.66 
 
 
255 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  56.5 
 
 
248 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  55.1 
 
 
258 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  56.61 
 
 
282 aa  260  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  54.09 
 
 
257 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  53.39 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  52.19 
 
 
252 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  48.59 
 
 
251 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.81 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  50 
 
 
597 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  47.77 
 
 
250 aa  231  7.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  49.79 
 
 
594 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  47.97 
 
 
251 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  50.81 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  47.81 
 
 
251 aa  221  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  50 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  46.15 
 
 
250 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 
250 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  44.53 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
250 aa  214  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  48.55 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  49.39 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  47.33 
 
 
246 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  48.32 
 
 
248 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  46.18 
 
 
249 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  45.38 
 
 
272 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 
251 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  52.3 
 
 
250 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  44.98 
 
 
267 aa  205  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  47.18 
 
 
251 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  43.55 
 
 
250 aa  204  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  43.55 
 
 
249 aa  204  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  44.53 
 
 
256 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  45.71 
 
 
264 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  43.82 
 
 
260 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  45.56 
 
 
250 aa  201  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  43.72 
 
 
256 aa  201  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  44.98 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  46.77 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  44.94 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  41.49 
 
 
842 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  45.12 
 
 
852 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  44.18 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  43.65 
 
 
252 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  42.32 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  46.06 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  42.51 
 
 
840 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  42.63 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  43.1 
 
 
249 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  43.93 
 
 
250 aa  195  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  43.2 
 
 
840 aa  195  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  42.56 
 
 
838 aa  195  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  44.81 
 
 
250 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  43.85 
 
 
254 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.96 
 
 
266 aa  194  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
257 aa  194  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.86 
 
 
256 aa  194  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.86 
 
 
256 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  43.85 
 
 
254 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  41.91 
 
 
257 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
257 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  40.98 
 
 
257 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  43.15 
 
 
863 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  43.59 
 
 
266 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
257 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
271 aa  193  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.17 
 
 
250 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
254 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  42.11 
 
 
256 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  42.4 
 
 
260 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  41.95 
 
 
249 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
257 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  43.03 
 
 
254 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  42.31 
 
 
266 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  42.31 
 
 
262 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  43.03 
 
 
254 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  40.33 
 
 
250 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  41.98 
 
 
252 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  41.43 
 
 
255 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  41.06 
 
 
257 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  41.84 
 
 
249 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  40.96 
 
 
255 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  45.56 
 
 
249 aa  188  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 
259 aa  187  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 
257 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  40.32 
 
 
250 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>