More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2418 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  81.57 
 
 		 260 aa  421  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  83 
 
 		 260 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  75.6 
 
 		 292 aa  387  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.23 
 
 		 254 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  68.53 
 
 		 255 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  71.26 
 
 		 254 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  69.69 
 
 		 254 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  69.29 
 
 		 254 aa  344  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  69.29 
 
 		 254 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  45.56 
 
 		 257 aa  225  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 257 aa  224  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  47.01 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  47.01 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  46.77 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  44.62 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  47.39 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  47.01 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 251 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  45.04 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  46.99 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  45.56 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  40.23 
 
 		 271 aa  205  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.94 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  46.59 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  43.95 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  45.24 
 
 		 842 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.74 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42.74 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  46.51 
 
 		 852 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  44.14 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.8 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  42.74 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  42.8 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  42.63 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  44.17 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  42.86 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  44.27 
 
 		 859 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  41.9 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  43.08 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  45.16 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  41.04 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  39.92 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  40.24 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  42.06 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  41.53 
 
 		 278 aa  191  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  43.15 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  41.13 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  41.86 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  41.34 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  40.96 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  40.39 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  42.11 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  42.86 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  46.85 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  44.76 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  42.17 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  42.35 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  39.84 
 
 		 265 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  42.8 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  42.35 
 
 		 840 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  37.02 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  41.83 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  40.16 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  43.78 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  39.69 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  37.4 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  42.29 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  39.69 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  39.69 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  41.11 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  41.11 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  39.2 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.11 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  41.73 
 
 		 251 aa  184  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  41.83 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  39.92 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  41.02 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  40.7 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  42.8 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  40.73 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  37.5 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  39.52 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>