More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4819 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  523  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  72.76 
 
 		 250 aa  364  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  71.88 
 
 		 254 aa  361  7.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  68.87 
 
 		 253 aa  357  7e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  71.98 
 
 		 250 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  59.61 
 
 		 258 aa  278  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  58.27 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  59.36 
 
 		 282 aa  271  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  57.94 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  54.72 
 
 		 257 aa  268  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  56.47 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  55.69 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  54.51 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  54.33 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  54.09 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  52.73 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  55.34 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  48.8 
 
 		 597 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  48.21 
 
 		 594 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  46.06 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  45.02 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  45.02 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  45.82 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  44.27 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  45.91 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  42.97 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  43.92 
 
 		 840 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  42.97 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  48.82 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  42.46 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  46.09 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  45.17 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  41.8 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  44.75 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.37 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  46.43 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  44.14 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  43.03 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  43.87 
 
 		 852 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  43.92 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  47.47 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  43.75 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  44.71 
 
 		 621 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  45.45 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  42.74 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  44.27 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  44.58 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  41.27 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  42.86 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  40.78 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  44.49 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  42.63 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  46.46 
 
 		 246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  41.83 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  41.18 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  43.25 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  41.43 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  41.02 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  42.23 
 
 		 266 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  42.19 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  44.84 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  41.43 
 
 		 840 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  43.85 
 
 		 249 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  42.42 
 
 		 267 aa  194  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  40.08 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  41.43 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  45.02 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  41.39 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  42.19 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  39.15 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  44.05 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  38.76 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  38.76 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  41.8 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  42.68 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.53 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  41.43 
 
 		 838 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  41.39 
 
 		 250 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  44.14 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  41.83 
 
 		 840 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  41.94 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  40.78 
 
 		 262 aa  191  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  41.86 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  42.28 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  41.18 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  41.73 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  39.68 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  40 
 
 		 863 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  40.56 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  41.57 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  38.76 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  43.92 
 
 		 484 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  43.39 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>