More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1048 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  100 
 
 
549 aa  1071    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  42.53 
 
 
827 aa  343  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  41.97 
 
 
823 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  41.4 
 
 
823 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  41.09 
 
 
822 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  40.3 
 
 
830 aa  329  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  39.88 
 
 
484 aa  310  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  40.99 
 
 
859 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  38.5 
 
 
828 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  38.09 
 
 
832 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  39.7 
 
 
842 aa  296  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  34.25 
 
 
555 aa  291  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  36.78 
 
 
494 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  36.87 
 
 
502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.72 
 
 
489 aa  282  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  36.63 
 
 
501 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  39.35 
 
 
852 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  37.11 
 
 
536 aa  280  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  37.52 
 
 
863 aa  276  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  36.86 
 
 
502 aa  274  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  37.89 
 
 
573 aa  274  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  36.42 
 
 
490 aa  272  9e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3584  ABC transporter related  38 
 
 
873 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282341  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  37.5 
 
 
840 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  35.36 
 
 
838 aa  263  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  35.89 
 
 
840 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  35.47 
 
 
840 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0382  ABC transporter related  34.71 
 
 
538 aa  239  9e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  35.95 
 
 
1302 aa  239  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  35.24 
 
 
505 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  36.72 
 
 
504 aa  236  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49 
 
 
236 aa  229  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  49 
 
 
236 aa  229  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  49.8 
 
 
236 aa  228  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  48.83 
 
 
247 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
238 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  49.8 
 
 
238 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  48.62 
 
 
247 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  48.58 
 
 
233 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  47.77 
 
 
237 aa  226  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.39 
 
 
238 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  47.37 
 
 
236 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  46.96 
 
 
237 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  47.77 
 
 
233 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 
247 aa  224  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 
234 aa  224  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  44.53 
 
 
236 aa  223  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  47.83 
 
 
247 aa  223  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 
241 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  50.61 
 
 
233 aa  223  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  47.41 
 
 
244 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  50.2 
 
 
238 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  47.04 
 
 
247 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  48.19 
 
 
258 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  48.18 
 
 
234 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  47.43 
 
 
247 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3616  ABC transporter related  46.96 
 
 
234 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  47.37 
 
 
234 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  46.15 
 
 
238 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  47.31 
 
 
249 aa  221  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  47.77 
 
 
237 aa  220  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  47.77 
 
 
237 aa  220  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
235 aa  219  7e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  48.18 
 
 
235 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  47.86 
 
 
247 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  49.39 
 
 
249 aa  219  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  47.04 
 
 
247 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  49.8 
 
 
233 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 
247 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  45.56 
 
 
246 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  46.56 
 
 
236 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  45.45 
 
 
264 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 
247 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  46.56 
 
 
231 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  47.56 
 
 
251 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
234 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  46.88 
 
 
247 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
233 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  42.11 
 
 
234 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  46.88 
 
 
247 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  46.96 
 
 
234 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  44.35 
 
 
232 aa  217  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  45.75 
 
 
233 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  45.34 
 
 
234 aa  217  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  48.05 
 
 
251 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
237 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
237 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  47.58 
 
 
235 aa  216  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
237 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
237 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
237 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  45.2 
 
 
237 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  44.98 
 
 
238 aa  216  8e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
236 aa  216  9e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  44.94 
 
 
235 aa  216  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  45.75 
 
 
234 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  46.56 
 
 
239 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  49.39 
 
 
260 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.92 
 
 
254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1952  ABC transporter related  45.34 
 
 
234 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.571715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>