More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5836 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  100 
 
 
272 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  88.24 
 
 
271 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  71.06 
 
 
278 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  49.61 
 
 
255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  48.62 
 
 
259 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  50 
 
 
255 aa  242  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  48.03 
 
 
259 aa  241  7e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  49.8 
 
 
283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  48.62 
 
 
271 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  45.05 
 
 
284 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  48.43 
 
 
589 aa  235  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  44.64 
 
 
302 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  48.44 
 
 
257 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  45.05 
 
 
284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  47.84 
 
 
258 aa  235  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
293 aa  235  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  48.62 
 
 
255 aa  235  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  44.29 
 
 
307 aa  234  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  48.12 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  48.12 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  47.43 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  47.45 
 
 
257 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  48.41 
 
 
254 aa  233  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  50.98 
 
 
294 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  49.8 
 
 
268 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  47.84 
 
 
257 aa  232  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  49.42 
 
 
275 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  49.42 
 
 
275 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  50.78 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  48.43 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  49.41 
 
 
252 aa  231  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  49.42 
 
 
275 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  50.2 
 
 
261 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  49.03 
 
 
264 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  51.76 
 
 
273 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  48.25 
 
 
259 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  47.66 
 
 
250 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 
253 aa  229  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50 
 
 
333 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  46.3 
 
 
256 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  50 
 
 
276 aa  228  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  50.4 
 
 
334 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 
256 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
259 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  47.88 
 
 
265 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  46.95 
 
 
259 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  47.24 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  47.45 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  47.04 
 
 
255 aa  225  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  47.01 
 
 
256 aa  224  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 
617 aa  224  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  45.98 
 
 
256 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  48.12 
 
 
271 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  44.19 
 
 
256 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
250 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  46.61 
 
 
256 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  47.04 
 
 
261 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.49 
 
 
251 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  46.77 
 
 
261 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  47.06 
 
 
277 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  46.8 
 
 
613 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  45.28 
 
 
265 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.92 
 
 
256 aa  222  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  50.39 
 
 
260 aa  222  6e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.77 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.57 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  45.86 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  46 
 
 
590 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.82 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  44.36 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  48.21 
 
 
252 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  48.41 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.88 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  46.22 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  46 
 
 
594 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  46.22 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  46.22 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  45.63 
 
 
594 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  46.8 
 
 
589 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  46.3 
 
 
270 aa  219  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  44.4 
 
 
265 aa  219  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  46.39 
 
 
270 aa  218  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.17 
 
 
262 aa  218  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  47.55 
 
 
261 aa  218  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
255 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  49.8 
 
 
256 aa  218  7.999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  46.25 
 
 
274 aa  218  7.999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
254 aa  218  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.61 
 
 
594 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  49.01 
 
 
270 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.42 
 
 
594 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
256 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  45.42 
 
 
594 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  47.51 
 
 
262 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  48.02 
 
 
280 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.42 
 
 
594 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  45.42 
 
 
594 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.42 
 
 
594 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>