More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2527 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  100 
 
 
266 aa  530  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  60.98 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  47.79 
 
 
256 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  48.59 
 
 
271 aa  228  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  45.93 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  45.93 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  46.75 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  47.79 
 
 
252 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  46.67 
 
 
252 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  45.53 
 
 
246 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  47.79 
 
 
260 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  48.8 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  45.91 
 
 
268 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  47.98 
 
 
859 aa  214  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  47.39 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  44.75 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  43.9 
 
 
258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  44.75 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  47.97 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  44.8 
 
 
278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  46.15 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  45.53 
 
 
257 aa  211  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  45.34 
 
 
251 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  45.12 
 
 
256 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 
271 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 
257 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  45.93 
 
 
257 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  46.15 
 
 
256 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  45.53 
 
 
256 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 
271 aa  208  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.5 
 
 
263 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 
257 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  43.5 
 
 
259 aa  208  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  46 
 
 
261 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  46.06 
 
 
272 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  44.94 
 
 
251 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  45.34 
 
 
251 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 
251 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  45.53 
 
 
256 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  44.31 
 
 
256 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  44.84 
 
 
263 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  43.09 
 
 
258 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 
277 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  44.31 
 
 
256 aa  204  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  42.28 
 
 
258 aa  204  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  43.9 
 
 
263 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  47.56 
 
 
248 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  43.58 
 
 
256 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.31 
 
 
257 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 
257 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.31 
 
 
257 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  44.94 
 
 
250 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  47.18 
 
 
252 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  43.55 
 
 
253 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 
257 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  43.78 
 
 
255 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  44.11 
 
 
842 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 
255 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 
257 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 
257 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 
257 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 
259 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 
259 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 
259 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 
259 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 
259 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 
259 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  43.9 
 
 
254 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 
259 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  46.53 
 
 
252 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  43.95 
 
 
255 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 
257 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  41.11 
 
 
257 aa  201  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  45.02 
 
 
251 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  43.31 
 
 
255 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
259 aa  201  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.5 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  47.15 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.67 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  43.5 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  43.5 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  43.5 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  43.5 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  46.77 
 
 
262 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  45.67 
 
 
255 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
257 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  44.76 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  44.27 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  43.09 
 
 
259 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  43.09 
 
 
259 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  43.65 
 
 
255 aa  198  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  43.9 
 
 
256 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  46.77 
 
 
262 aa  198  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  43.5 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  46.37 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  45.56 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.57 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  45.53 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>