More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4701 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  61.6 
 
 		 840 aa  909    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  100 
 
 		 840 aa  1676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  61.11 
 
 		 840 aa  920    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  60.89 
 
 		 852 aa  972    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  60.41 
 
 		 863 aa  930    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  53.78 
 
 		 838 aa  867    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  39.95 
 
 		 842 aa  525  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  39.3 
 
 		 859 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  36.03 
 
 		 830 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  38.43 
 
 		 823 aa  429  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  38.07 
 
 		 822 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  38.18 
 
 		 823 aa  426  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  39.34 
 
 		 827 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  35.08 
 
 		 832 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  36 
 
 		 828 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  38.91 
 
 		 484 aa  317  6e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  37.82 
 
 		 536 aa  311  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  33.67 
 
 		 621 aa  307  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.13 
 
 		 632 aa  290  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  31.88 
 
 		 625 aa  281  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  33.56 
 
 		 594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 489 aa  273  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  34.27 
 
 		 597 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  36.44 
 
 		 494 aa  268  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  36.16 
 
 		 501 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3584  ABC transporter related  31.04 
 
 		 873 aa  259  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282341  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  36.36 
 
 		 504 aa  258  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  35.61 
 
 		 502 aa  256  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  34.99 
 
 		 505 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  35.49 
 
 		 502 aa  252  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  31.76 
 
 		 593 aa  251  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  33.97 
 
 		 549 aa  251  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  34.72 
 
 		 573 aa  250  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  31.98 
 
 		 593 aa  250  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  32.98 
 
 		 606 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  31.69 
 
 		 593 aa  248  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  32.83 
 
 		 589 aa  245  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  34.32 
 
 		 590 aa  243  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  32.16 
 
 		 598 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  32.46 
 
 		 630 aa  241  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  30.6 
 
 		 594 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.6 
 
 		 594 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.6 
 
 		 594 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.6 
 
 		 594 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  31.58 
 
 		 603 aa  237  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  30.43 
 
 		 594 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.43 
 
 		 594 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.43 
 
 		 594 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  33.47 
 
 		 490 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.1 
 
 		 594 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  30.13 
 
 		 594 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  30.27 
 
 		 594 aa  234  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  31.26 
 
 		 589 aa  233  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6071  ABC transporter related  28.79 
 
 		 615 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.461067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  30.22 
 
 		 594 aa  233  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  30.66 
 
 		 594 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  31.49 
 
 		 594 aa  231  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  32.2 
 
 		 608 aa  230  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  32.68 
 
 		 611 aa  230  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  29.93 
 
 		 594 aa  230  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  30.49 
 
 		 594 aa  230  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.7 
 
 		 594 aa  229  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  31.05 
 
 		 660 aa  228  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  30.03 
 
 		 594 aa  228  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  32.07 
 
 		 589 aa  228  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  33.73 
 
 		 631 aa  227  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  29.03 
 
 		 663 aa  227  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  32.09 
 
 		 583 aa  227  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  31.38 
 
 		 593 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  30.76 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  31.69 
 
 		 950 aa  226  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  31.67 
 
 		 590 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  33.51 
 
 		 597 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  34.92 
 
 		 608 aa  224  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  32.03 
 
 		 597 aa  223  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  30.98 
 
 		 589 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  30.9 
 
 		 614 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  32.77 
 
 		 604 aa  221  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  30.57 
 
 		 599 aa  219  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  32.17 
 
 		 589 aa  217  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  30.1 
 
 		 599 aa  217  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 611 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  32.47 
 
 		 565 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  28.62 
 
 		 594 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  33.8 
 
 		 954 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  30.18 
 
 		 616 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  32.4 
 
 		 951 aa  213  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  33.28 
 
 		 604 aa  212  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  28.13 
 
 		 648 aa  212  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  31.69 
 
 		 590 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  41.49 
 
 		 249 aa  211  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  33.16 
 
 		 595 aa  211  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  49.37 
 
 		 234 aa  210  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  29.34 
 
 		 647 aa  210  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  32.27 
 
 		 590 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 250 aa  209  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  40.66 
 
 		 249 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  32.01 
 
 		 588 aa  209  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  43.21 
 
 		 250 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 		 250 aa  206  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>