More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0908 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  100 
 
 		 761 aa  1459    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  99.08 
 
 		 758 aa  1149    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  78.95 
 
 		 741 aa  921    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  98.94 
 
 		 755 aa  1122    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  97.87 
 
 		 752 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  98.66 
 
 		 746 aa  1130    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  99.6 
 
 		 749 aa  1434    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  98.53 
 
 		 746 aa  1120    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2817  inner-membrane translocator  59.13 
 
 		 430 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678214  normal  0.0943993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1295  inner-membrane translocator  65.17 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1334  inner-membrane translocator  64.27 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1319  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  61.36 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1393  inner-membrane translocator  63.54 
 
 		 409 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0933  inner-membrane translocator  64.56 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.532515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1415  inner-membrane translocator  64.56 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446365  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1900  inner-membrane translocator  66.14 
 
 		 405 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4559  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  64 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  65.84 
 
 		 249 aa  308  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1606  inner-membrane translocator  61.13 
 
 		 419 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  65.43 
 
 		 249 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  43.46 
 
 		 437 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  65.84 
 
 		 250 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  66.95 
 
 		 250 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  65.84 
 
 		 250 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  64.61 
 
 		 250 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  65.84 
 
 		 250 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  63.01 
 
 		 250 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  44.47 
 
 		 439 aa  300  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  61.38 
 
 		 250 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1493  inner-membrane translocator  48.14 
 
 		 444 aa  297  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.532886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1452  inner-membrane translocator  48.14 
 
 		 444 aa  297  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0642822  hitchhiker  0.000453493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1752  amino acid ABC transporter permease  54.7 
 
 		 440 aa  296  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  62.7 
 
 		 256 aa  296  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2932  inner-membrane translocator  42.82 
 
 		 440 aa  282  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.303159  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  53.23 
 
 		 257 aa  270  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2023  inner-membrane translocator  43.32 
 
 		 445 aa  265  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.102668  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1681  inner-membrane translocator  43.56 
 
 		 445 aa  264  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  51.81 
 
 		 259 aa  263  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  43.17 
 
 		 441 aa  262  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  53.17 
 
 		 266 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1795  inner-membrane translocator  46.63 
 
 		 422 aa  261  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4169  inner-membrane translocator  42.78 
 
 		 433 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1572  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 433 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  54.88 
 
 		 253 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2928  inner-membrane translocator  48 
 
 		 442 aa  255  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0634587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4566  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 433 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163512  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  51.22 
 
 		 266 aa  254  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  52.87 
 
 		 249 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3310  inner-membrane translocator  44.28 
 
 		 454 aa  253  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.021749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2576  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 430 aa  253  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262012  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  50.61 
 
 		 262 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1578  inner-membrane translocator  43.41 
 
 		 433 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  52.46 
 
 		 249 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  51 
 
 		 250 aa  251  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1839  inner-membrane translocator  49.63 
 
 		 434 aa  249  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  55.6 
 
 		 249 aa  248  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  52.05 
 
 		 249 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  48.8 
 
 		 264 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  47.98 
 
 		 258 aa  247  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  50.4 
 
 		 253 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  49.4 
 
 		 266 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  51 
 
 		 257 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  47.54 
 
 		 259 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  47.37 
 
 		 258 aa  243  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  53.39 
 
 		 250 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  48.59 
 
 		 260 aa  242  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  48.59 
 
 		 260 aa  242  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3167  inner-membrane translocator  48.52 
 
 		 442 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581238  normal  0.308914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2389  inner-membrane translocator  46.46 
 
 		 429 aa  240  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0550478  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1772  putative amino acid transport system permease lipoprotein transmembrane  44.7 
 
 		 430 aa  238  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1851  inner-membrane translocator  48.76 
 
 		 432 aa  234  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 250 aa  232  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  48.19 
 
 		 269 aa  232  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 250 aa  229  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  46.89 
 
 		 275 aa  224  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  46.44 
 
 		 252 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  47.74 
 
 		 248 aa  195  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 		 255 aa  195  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42.34 
 
 		 254 aa  194  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  41.94 
 
 		 254 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  41.67 
 
 		 250 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  39.92 
 
 		 254 aa  189  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  45.31 
 
 		 251 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  39.16 
 
 		 266 aa  189  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  43.39 
 
 		 250 aa  188  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  41.18 
 
 		 250 aa  188  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  41.5 
 
 		 255 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  41.7 
 
 		 256 aa  187  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  42.04 
 
 		 250 aa  187  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0501  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.42 
 
 		 264 aa  187  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  45.53 
 
 		 249 aa  187  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  42.68 
 
 		 252 aa  187  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  40.96 
 
 		 256 aa  186  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  41.94 
 
 		 252 aa  186  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  43.16 
 
 		 272 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  45.2 
 
 		 251 aa  184  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  44.8 
 
 		 252 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  39.18 
 
 		 256 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  39.18 
 
 		 256 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  43.39 
 
 		 250 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>