More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2652 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  79.9 
 
 		 755 aa  895    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  80.44 
 
 		 761 aa  908    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  80.71 
 
 		 746 aa  896    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  81.01 
 
 		 758 aa  913    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  80.53 
 
 		 749 aa  899    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  100 
 
 		 741 aa  1409    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  80.47 
 
 		 752 aa  904    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  81.11 
 
 		 746 aa  905    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2817  inner-membrane translocator  64.18 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678214  normal  0.0943993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1319  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  62.88 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1295  inner-membrane translocator  64.27 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1334  inner-membrane translocator  63.1 
 
 		 408 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1393  inner-membrane translocator  62.03 
 
 		 409 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0933  inner-membrane translocator  62.53 
 
 		 409 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.532515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1415  inner-membrane translocator  62.53 
 
 		 409 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446365  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4559  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  62.96 
 
 		 409 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1900  inner-membrane translocator  64.38 
 
 		 405 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1606  inner-membrane translocator  63.53 
 
 		 419 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  67.9 
 
 		 250 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  67.49 
 
 		 249 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  68.31 
 
 		 250 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  68.31 
 
 		 250 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  67.08 
 
 		 249 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  68.67 
 
 		 250 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  68.31 
 
 		 250 aa  313  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  63.82 
 
 		 250 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  62.2 
 
 		 250 aa  303  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 439 aa  296  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  62.7 
 
 		 256 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1752  amino acid ABC transporter permease  54.36 
 
 		 440 aa  296  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  49.5 
 
 		 437 aa  296  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1452  inner-membrane translocator  46.57 
 
 		 444 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0642822  hitchhiker  0.000453493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1493  inner-membrane translocator  47.04 
 
 		 444 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.532886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2932  inner-membrane translocator  43.28 
 
 		 440 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.303159  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  52.23 
 
 		 257 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1795  inner-membrane translocator  47.97 
 
 		 422 aa  264  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  43.41 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  52.59 
 
 		 266 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2023  inner-membrane translocator  44.57 
 
 		 445 aa  261  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.102668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4169  inner-membrane translocator  43.42 
 
 		 433 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  50.81 
 
 		 259 aa  261  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1681  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 445 aa  260  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1839  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 434 aa  259  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2576  inner-membrane translocator  43.87 
 
 		 430 aa  257  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262012  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1572  inner-membrane translocator  44.85 
 
 		 433 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  53.06 
 
 		 249 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2928  inner-membrane translocator  45.65 
 
 		 442 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0634587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4566  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 433 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163512  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  50.4 
 
 		 266 aa  253  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  52.87 
 
 		 249 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1578  inner-membrane translocator  43.41 
 
 		 433 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  49.8 
 
 		 262 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  53.66 
 
 		 253 aa  251  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  52.24 
 
 		 249 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  51.39 
 
 		 253 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  56.22 
 
 		 249 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2389  inner-membrane translocator  44.79 
 
 		 429 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0550478  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  51 
 
 		 257 aa  247  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  47.98 
 
 		 258 aa  245  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  54.4 
 
 		 250 aa  244  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  50 
 
 		 266 aa  243  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  48.62 
 
 		 264 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  49.6 
 
 		 250 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  46.72 
 
 		 259 aa  242  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1772  putative amino acid transport system permease lipoprotein transmembrane  44.27 
 
 		 430 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3167  inner-membrane translocator  48.52 
 
 		 442 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581238  normal  0.308914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  46.96 
 
 		 258 aa  240  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3310  inner-membrane translocator  42.39 
 
 		 454 aa  238  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.021749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1851  inner-membrane translocator  47.7 
 
 		 432 aa  236  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  47.39 
 
 		 260 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  47.39 
 
 		 260 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 250 aa  231  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 250 aa  229  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  45.93 
 
 		 269 aa  223  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  45.9 
 
 		 275 aa  218  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  43.67 
 
 		 256 aa  196  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  46.41 
 
 		 252 aa  193  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42.17 
 
 		 254 aa  193  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  40.91 
 
 		 254 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.17 
 
 		 254 aa  192  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  41.39 
 
 		 250 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  42.8 
 
 		 252 aa  192  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  41.22 
 
 		 256 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  41.22 
 
 		 256 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  43.27 
 
 		 250 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  42.86 
 
 		 252 aa  191  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  41.7 
 
 		 250 aa  191  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 266 aa  190  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0501  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.72 
 
 		 264 aa  190  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3132  ABC transporter related  40.94 
 
 		 256 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0678345  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  43.5 
 
 		 252 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  47.13 
 
 		 248 aa  188  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  46.31 
 
 		 249 aa  188  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2762  ABC transporter related  40.71 
 
 		 256 aa  188  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  40.32 
 
 		 256 aa  187  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  40.94 
 
 		 256 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  43.62 
 
 		 251 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  41.25 
 
 		 255 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  43.98 
 
 		 272 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  42.32 
 
 		 252 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>