More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3087 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  100 
 
 
321 aa  630  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  77.99 
 
 
320 aa  472  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  70.22 
 
 
322 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  53.57 
 
 
368 aa  345  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  57.38 
 
 
340 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  55.35 
 
 
340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  53.5 
 
 
338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  53.53 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  51.11 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  49.54 
 
 
333 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4820  inner-membrane translocator  55.67 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  46.77 
 
 
594 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  52.6 
 
 
363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  53.64 
 
 
354 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  52.94 
 
 
361 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  45.45 
 
 
597 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  49.69 
 
 
324 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  42.99 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.15 
 
 
315 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  43.64 
 
 
315 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  44.52 
 
 
313 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  46.13 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  38.46 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  41.97 
 
 
340 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  48.93 
 
 
336 aa  192  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  36.42 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  45.17 
 
 
304 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  41.41 
 
 
333 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  40.82 
 
 
333 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  40.53 
 
 
316 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  41.26 
 
 
334 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  41.26 
 
 
344 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  37.69 
 
 
358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  37.19 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  40.97 
 
 
329 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  41.95 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  40.99 
 
 
309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  39.6 
 
 
652 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  44.06 
 
 
324 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  41.38 
 
 
327 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  40.74 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
323 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  43.68 
 
 
324 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  38.18 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.32 
 
 
323 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  36.74 
 
 
346 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  40.65 
 
 
314 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  40.37 
 
 
328 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  40.71 
 
 
323 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  40.3 
 
 
332 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  42.48 
 
 
320 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  41.81 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  41.27 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  40.93 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  35.1 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  35.1 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  39.02 
 
 
314 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  41.43 
 
 
318 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  38.05 
 
 
346 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  40.56 
 
 
334 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3988  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 
324 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1605  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 
324 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  40.69 
 
 
330 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0196  putative branched-chain amino acid ABC transporter integral membrane subunit  44.88 
 
 
324 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.47626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3373  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 
324 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2997  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 
324 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4062  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 
324 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  36.6 
 
 
324 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  41.78 
 
 
328 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  39.66 
 
 
339 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.66 
 
 
324 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3327  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.76 
 
 
324 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
349 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1210  inner-membrane translocator  43.36 
 
 
334 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  38.91 
 
 
313 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  34.53 
 
 
332 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  36.48 
 
 
323 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  36.48 
 
 
324 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  35.14 
 
 
351 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0838  inner-membrane translocator  36.53 
 
 
345 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.825897  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  36.66 
 
 
323 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 
331 aa  165  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  42.65 
 
 
337 aa  165  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  35.02 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  34.9 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  35.83 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  38.14 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  42.02 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  36.52 
 
 
318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.46 
 
 
355 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  40.43 
 
 
306 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3210  inner-membrane translocator  36.89 
 
 
331 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.756428  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  42.12 
 
 
349 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  36.78 
 
 
339 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  39.58 
 
 
330 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1285  inner-membrane translocator  43.32 
 
 
326 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168466  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  38.28 
 
 
329 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  37.73 
 
 
332 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>