More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2770 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  100 
 
 		 320 aa  627  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  77.99 
 
 		 321 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  68.01 
 
 		 322 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  53.11 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  53.42 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  52.19 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  51.88 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  55.02 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  53.14 
 
 		 337 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  50.62 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  48.5 
 
 		 594 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  50 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4820  inner-membrane translocator  53.19 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  51.8 
 
 		 361 aa  258  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  47.95 
 
 		 597 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  50.67 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  52.32 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  43.08 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  46.34 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.15 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  42.01 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  43.19 
 
 		 304 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  43.62 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 346 aa  185  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 652 aa  185  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  40.98 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  40 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  39.64 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 336 aa  178  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  39.52 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  41.89 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  42.19 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  41.48 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.82 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 320 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  40 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.01 
 
 		 331 aa  169  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  39.41 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  40.15 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  35.74 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  40.3 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  41.33 
 
 		 323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  42.7 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  38.05 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 335 aa  162  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  41.85 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  37.55 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0838  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.825897  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  37.55 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3327  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.64 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3373  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4062  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0196  putative branched-chain amino acid ABC transporter integral membrane subunit  41.67 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.47626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2997  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1605  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.8 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3988  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  37.23 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  42.75 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1210  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0087  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 324 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>