More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4660 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  100 
 
 		 343 aa  671    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  88.63 
 
 		 346 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  43.92 
 
 		 594 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  43.31 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  46.13 
 
 		 597 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  41.35 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  45.86 
 
 		 337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  43.03 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  41.87 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  43.53 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  42.62 
 
 		 361 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  41.73 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  42.7 
 
 		 363 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  45.68 
 
 		 354 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 324 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4820  inner-membrane translocator  45.42 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  41.78 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  43.24 
 
 		 327 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.71 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 327 aa  186  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  43.38 
 
 		 320 aa  185  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  41.52 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  38.64 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  43.1 
 
 		 304 aa  179  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  41.84 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  41.84 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  38.92 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 334 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  42.7 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3828  inner-membrane translocator  43.46 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 358 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 324 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  36.55 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 652 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.43 
 
 		 656 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3641  inner-membrane translocator  44.84 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  40.55 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.96 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 330 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  41.43 
 
 		 328 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 323 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 323 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1210  inner-membrane translocator  41.76 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.4 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  38.03 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3327  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.72 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  41.83 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3242  inner-membrane translocator  40.16 
 
 		 329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194129  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.22 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  40 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>