More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4000 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  100 
 
 		 337 aa  654    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  61.77 
 
 		 313 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1210  inner-membrane translocator  68.9 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3641  inner-membrane translocator  65.7 
 
 		 334 aa  315  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.88 
 
 		 315 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  47.84 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  44.31 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  45.99 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  48.1 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  47.67 
 
 		 336 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  44.63 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  43.31 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  47.89 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 346 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 327 aa  218  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 349 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  43.46 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  45.64 
 
 		 320 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  41.85 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  42.35 
 
 		 333 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  42.23 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  41.08 
 
 		 594 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 335 aa  195  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3828  inner-membrane translocator  45.91 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  42.32 
 
 		 597 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  39.45 
 
 		 329 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  39.45 
 
 		 322 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 652 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0860  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.18038  normal  0.215748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 314 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 344 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  41.27 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 358 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4045  inner-membrane translocator  46.62 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.97 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  33.23 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 354 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1379  inner-membrane translocator  34.37 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 340 aa  152  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8053  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.76 
 
 		 656 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2247  transmembrane ABC transporter protein  37.22 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0431032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  35.64 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 642 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  35.87 
 
 		 838 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3242  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 329 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194129  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 324 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.78 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0500  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.71 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0771469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.33 
 
 		 646 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  37.6 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  40 
 
 		 363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  37.41 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>