More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3172 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  100 
 
 		 336 aa  654    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  58.76 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  62.24 
 
 		 306 aa  311  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  52.6 
 
 		 324 aa  305  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  52.7 
 
 		 315 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  55.12 
 
 		 304 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  56.37 
 
 		 316 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  57.84 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  56.01 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3828  inner-membrane translocator  55.43 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  51.23 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  44.16 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  48.01 
 
 		 337 aa  239  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 346 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  49.68 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  42.28 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3641  inner-membrane translocator  53.76 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1210  inner-membrane translocator  52.41 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  42.37 
 
 		 318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  44.84 
 
 		 327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  43.14 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4045  inner-membrane translocator  59.07 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 320 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  45.39 
 
 		 361 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  42.94 
 
 		 594 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  43.81 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  43.2 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  43.97 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  40.24 
 
 		 346 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  45.85 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  41.04 
 
 		 597 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 343 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 358 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  41.91 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  40.98 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  40.35 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  41.38 
 
 		 652 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 329 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  43.21 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0860  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.18038  normal  0.215748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  39.92 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  41.85 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 344 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.19 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  41 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2452  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  42.64 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  41.91 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.33 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 342 aa  165  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4820  inner-membrane translocator  45.13 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2247  transmembrane ABC transporter protein  37.99 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0431032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2059  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 314 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 311 aa  159  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1285  inner-membrane translocator  41.6 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  38.99 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  36.53 
 
 		 852 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  36 
 
 		 351 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  37.54 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>