More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4820 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4820  inner-membrane translocator  100 
 
 		 337 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  70.75 
 
 		 368 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  71.04 
 
 		 340 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  68.22 
 
 		 340 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  69.52 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  50.83 
 
 		 320 aa  279  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  54.07 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  51.38 
 
 		 321 aa  262  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  46.11 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  48.82 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  45.29 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  45.25 
 
 		 594 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  44.06 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  45.11 
 
 		 361 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  51.22 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  47.32 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  43.51 
 
 		 597 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  48.16 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.96 
 
 		 315 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  41.79 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 315 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  40 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 358 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  43.52 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  42.39 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  38.23 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 316 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 320 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  45.74 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  41.7 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 652 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  36.78 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  35.6 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 637 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0666  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component  32.35 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4109  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.79 
 
 		 646 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  37.77 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3828  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  37.77 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2452  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  30.97 
 
 		 632 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 646 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 333 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  36.04 
 
 		 838 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  32.34 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2247  transmembrane ABC transporter protein  36.53 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0431032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  33.99 
 
 		 628 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4363  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.3 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0943  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 324 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0838  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.825897  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1046  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  36.29 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 642 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 655 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2618  putative membrane protein of urea ABC transport system  31.96 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0303421  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2059  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1363  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1513  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  0.69839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>