More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1331 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  100 
 
 		 363 aa  717    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  85.29 
 
 		 354 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  54.19 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  51.44 
 
 		 335 aa  288  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  53.61 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  49.85 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  53.92 
 
 		 361 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  56.12 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  51.43 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  45.72 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  47.24 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  46.33 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  45.13 
 
 		 594 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  48.24 
 
 		 338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  45.36 
 
 		 597 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 346 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4820  inner-membrane translocator  49.64 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 		 315 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  42.46 
 
 		 315 aa  213  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  45 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  40.97 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  43.99 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  38.96 
 
 		 346 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  42.55 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 652 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  42.47 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  38.17 
 
 		 342 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 349 aa  159  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 335 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 358 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  36.39 
 
 		 852 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3828  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  39.57 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.85 
 
 		 355 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 340 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.37 
 
 		 323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 309 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  36.43 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3460  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5726  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6090  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4109  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0838  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.825897  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3726  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6573  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176253  normal  0.0417549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3210  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.756428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 323 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>