More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3828 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3828  inner-membrane translocator  100 
 
 		 320 aa  608  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  59.35 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  65.53 
 
 		 327 aa  328  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  64.29 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  51.22 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  48.67 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.02 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  49.65 
 
 		 306 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  54.9 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  50.77 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  41 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  44.89 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  45.15 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  42.95 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4045  inner-membrane translocator  51.93 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  42.43 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 361 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  39.75 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3641  inner-membrane translocator  46.76 
 
 		 334 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  42.99 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  40.76 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  38.49 
 
 		 594 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  39.26 
 
 		 597 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 368 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 354 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1210  inner-membrane translocator  45.2 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  39.77 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 342 aa  148  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  37.64 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 337 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 337 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.31 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.72 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  42.34 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4820  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2247  transmembrane ABC transporter protein  36.75 
 
 		 341 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0431032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.7 
 
 		 656 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0860  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.18038  normal  0.215748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  35.69 
 
 		 838 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  37.39 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5446  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  35.26 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 330 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.64 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  33.07 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2452  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  30.85 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2059  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  39.09 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 351 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  33.02 
 
 		 628 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>