More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3458 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  98.17 
 
 		 328 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  100 
 
 		 328 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  40.07 
 
 		 852 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  41.56 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  40.24 
 
 		 340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  40.42 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 342 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  41.97 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 327 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  39.12 
 
 		 840 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.64 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  41.32 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  41.67 
 
 		 838 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 332 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.11 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  37.03 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  40.3 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.95 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.27 
 
 		 355 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1379  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  38.41 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  38.77 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  38.77 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.87 
 
 		 646 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 633 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 646 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 333 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3327  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  40.07 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2997  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0196  putative branched-chain amino acid ABC transporter integral membrane subunit  36.07 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.47626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.6 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4062  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  39.73 
 
 		 863 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1605  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3373  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3988  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  31.05 
 
 		 842 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3210  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.756428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 336 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2932  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 318 aa  152  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4906  inner-membrane translocator  39.05 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3829  inner-membrane translocator  39.05 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  37.18 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  36 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1175  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6573  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176253  normal  0.0417549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  35.03 
 
 		 621 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 652 aa  149  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5726  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>