More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0936 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 656 aa  1286    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  64.95 
 
 		 295 aa  352  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  64.6 
 
 		 295 aa  349  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  61.17 
 
 		 295 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  60.82 
 
 		 295 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  60.82 
 
 		 293 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1399  inner-membrane translocator  65.29 
 
 		 295 aa  337  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  61.51 
 
 		 294 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  61.51 
 
 		 294 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  61.86 
 
 		 294 aa  333  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  61.51 
 
 		 295 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60.75 
 
 		 294 aa  333  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  61.51 
 
 		 295 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  53.54 
 
 		 333 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  61.51 
 
 		 313 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  61.86 
 
 		 294 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  61.86 
 
 		 294 aa  332  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  61.17 
 
 		 294 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60.07 
 
 		 287 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60.07 
 
 		 294 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  60.07 
 
 		 294 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  60.07 
 
 		 294 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  60.07 
 
 		 294 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  60.07 
 
 		 294 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  60.07 
 
 		 294 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  60.48 
 
 		 294 aa  330  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  60.48 
 
 		 295 aa  330  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  60.82 
 
 		 320 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  60.82 
 
 		 320 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  60.82 
 
 		 294 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  61.86 
 
 		 294 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  57.54 
 
 		 309 aa  329  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  55.37 
 
 		 314 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  61.86 
 
 		 294 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  54.14 
 
 		 314 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  60.07 
 
 		 295 aa  326  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  57.54 
 
 		 340 aa  324  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  55.25 
 
 		 330 aa  323  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2867  inner-membrane translocator  63.23 
 
 		 295 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  55.12 
 
 		 323 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  57.09 
 
 		 301 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  53.74 
 
 		 331 aa  318  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  55.97 
 
 		 344 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  60.82 
 
 		 291 aa  317  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  50.62 
 
 		 323 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  61.77 
 
 		 291 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  54.42 
 
 		 324 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  60.14 
 
 		 296 aa  313  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  54.42 
 
 		 330 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6726  inner-membrane translocator  61.07 
 
 		 295 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  60.14 
 
 		 295 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  53.95 
 
 		 332 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  53.36 
 
 		 324 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5820  inner-membrane translocator  61.07 
 
 		 295 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  61.09 
 
 		 291 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3517  inner-membrane translocator  60.14 
 
 		 294 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1438  inner-membrane translocator  61.17 
 
 		 293 aa  309  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.683973 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  59.64 
 
 		 295 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  56.12 
 
 		 313 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  54.76 
 
 		 329 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3289  hypothetical protein  60.82 
 
 		 295 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0960576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  54.87 
 
 		 332 aa  307  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  50 
 
 		 342 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  52.3 
 
 		 322 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  52.92 
 
 		 332 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  52.92 
 
 		 332 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3306  inner-membrane translocator  60.07 
 
 		 295 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.605647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  58.76 
 
 		 287 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  60.14 
 
 		 291 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  48.36 
 
 		 328 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  47.98 
 
 		 343 aa  302  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  53.5 
 
 		 331 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8053  inner-membrane translocator  53.5 
 
 		 331 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  49.69 
 
 		 329 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  56.94 
 
 		 311 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  55.78 
 
 		 313 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1379  inner-membrane translocator  54.92 
 
 		 317 aa  301  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6268  inner-membrane translocator  60.85 
 
 		 294 aa  300  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.770597  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  53.66 
 
 		 329 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  56.64 
 
 		 323 aa  299  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  57.09 
 
 		 328 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1676  inner-membrane translocator  51.11 
 
 		 323 aa  296  9e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2952  inner-membrane translocator  61.17 
 
 		 291 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3242  inner-membrane translocator  57.09 
 
 		 329 aa  293  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194129  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5954  inner-membrane translocator  57.04 
 
 		 295 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00927263  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3780  inner-membrane translocator  58.72 
 
 		 294 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  59.11 
 
 		 294 aa  291  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  48.67 
 
 		 332 aa  291  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  52.58 
 
 		 323 aa  289  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3530  inner-membrane translocator  60.14 
 
 		 294 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902092  normal  0.626427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  51.89 
 
 		 323 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 652 aa  288  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  49.03 
 
 		 339 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  49.67 
 
 		 344 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  49.51 
 
 		 324 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  49.31 
 
 		 334 aa  284  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  49.01 
 
 		 318 aa  283  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3484  inner-membrane translocator  59.79 
 
 		 291 aa  281  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  48.86 
 
 		 324 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3518  inner-membrane translocator  52.15 
 
 		 332 aa  281  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.507962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>