More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4451 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  100 
 
 		 295 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  100 
 
 		 293 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  98.31 
 
 		 295 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  92.2 
 
 		 295 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  73.22 
 
 		 295 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  73.56 
 
 		 295 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  72.26 
 
 		 294 aa  400  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  72.26 
 
 		 294 aa  400  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  72.26 
 
 		 294 aa  400  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  72.26 
 
 		 294 aa  400  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  72.95 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  72.26 
 
 		 294 aa  400  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  72.26 
 
 		 294 aa  400  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  71.58 
 
 		 294 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1399  inner-membrane translocator  74.92 
 
 		 295 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  71.58 
 
 		 294 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  72.26 
 
 		 294 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  71.92 
 
 		 294 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  71.58 
 
 		 320 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  71.58 
 
 		 320 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  71.58 
 
 		 294 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  72.41 
 
 		 313 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  71.58 
 
 		 294 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  70.55 
 
 		 294 aa  394  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1438  inner-membrane translocator  76.37 
 
 		 293 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.683973 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  71.58 
 
 		 294 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  71.92 
 
 		 294 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  71.23 
 
 		 294 aa  394  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  72.38 
 
 		 287 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  73.22 
 
 		 295 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3306  inner-membrane translocator  76.53 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.605647  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  73.56 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  75.61 
 
 		 287 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  72.88 
 
 		 295 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  70.55 
 
 		 296 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2867  inner-membrane translocator  74.24 
 
 		 295 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  74.22 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  73.87 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  73.52 
 
 		 291 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3517  inner-membrane translocator  69.18 
 
 		 294 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  72.11 
 
 		 295 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  71.77 
 
 		 295 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5820  inner-membrane translocator  74.92 
 
 		 295 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3289  hypothetical protein  73.56 
 
 		 295 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0960576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  70.99 
 
 		 294 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6726  inner-membrane translocator  74.92 
 
 		 295 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  72.82 
 
 		 291 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1378  inner-membrane translocator  75 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2952  inner-membrane translocator  76.04 
 
 		 291 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3780  inner-membrane translocator  69.97 
 
 		 294 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1676  inner-membrane translocator  74.13 
 
 		 287 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  64.09 
 
 		 301 aa  348  7e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5954  inner-membrane translocator  65.31 
 
 		 295 aa  345  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00927263  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6268  inner-membrane translocator  67.47 
 
 		 294 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.770597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3484  inner-membrane translocator  72.99 
 
 		 291 aa  342  5e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3530  inner-membrane translocator  68.94 
 
 		 294 aa  341  7e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902092  normal  0.626427 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  60.82 
 
 		 656 aa  338  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3118  inner-membrane translocator  71.67 
 
 		 294 aa  334  9e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2931  inner-membrane translocator  68.14 
 
 		 295 aa  329  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4076  inner-membrane translocator  71.33 
 
 		 294 aa  326  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2464  inner-membrane translocator  70.99 
 
 		 294 aa  325  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1078  inner-membrane translocator  67.58 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0299849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5161  inner-membrane translocator  69.97 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4078  inner-membrane translocator  68.94 
 
 		 294 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0009  inner-membrane translocator  70.44 
 
 		 294 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.30949  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0009  inner-membrane translocator  65.69 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.978164  normal  0.0292693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1284  inner-membrane translocator  71.67 
 
 		 294 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2138  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  71.58 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1819  inner-membrane translocator  71.58 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  56.45 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  50.18 
 
 		 293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  51.61 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2582  inner-membrane translocator  56.36 
 
 		 291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.88 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  44.8 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 296 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 289 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  41.43 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  37.99 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 652 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  40.23 
 
 		 293 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  41.43 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  41.43 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>