More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3557 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  100 
 
 		 296 aa  551  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  98.99 
 
 		 296 aa  547  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  98.99 
 
 		 296 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  96.22 
 
 		 296 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  88.01 
 
 		 296 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  73.17 
 
 		 290 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  62.41 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  43.36 
 
 		 291 aa  211  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.48 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  44.14 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  44.06 
 
 		 291 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 294 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  44.88 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  43.26 
 
 		 652 aa  208  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  45.22 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  44.8 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  43.86 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.57 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  46.48 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  43.93 
 
 		 294 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  44.8 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.65 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  44.8 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2810  inner-membrane translocator  46.07 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  45.58 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  42.47 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  41.26 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  44.49 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3517  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  45 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  44.37 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  43.01 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.86 
 
 		 656 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  46.13 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  46.13 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2582  inner-membrane translocator  51.23 
 
 		 291 aa  195  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2952  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  43.66 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  41.58 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  45.2 
 
 		 286 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 285 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  43.73 
 
 		 285 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  44.33 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1438  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.683973 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1399  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 295 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  40 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3530  inner-membrane translocator  47.86 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902092  normal  0.626427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1378  inner-membrane translocator  44.37 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  43.94 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 287 aa  185  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2565  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.73 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6726  inner-membrane translocator  42.8 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2867  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  42.51 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3484  inner-membrane translocator  43.54 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1753  inner-membrane translocator  40.42 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4078  inner-membrane translocator  48.21 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5820  inner-membrane translocator  42.8 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3306  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.605647  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5954  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00927263  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6268  inner-membrane translocator  41.97 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.770597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  45.04 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 313 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>