More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2031 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  100 
 
 		 300 aa  573  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  57 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2582  inner-membrane translocator  66.1 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  57.35 
 
 		 295 aa  292  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  59.45 
 
 		 291 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  59.45 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  57 
 
 		 293 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  59.3 
 
 		 291 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  55.56 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  56.45 
 
 		 295 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  56.45 
 
 		 293 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  56.7 
 
 		 291 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  56.1 
 
 		 295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  55.9 
 
 		 295 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  55.56 
 
 		 295 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.85 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  53.31 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  53.31 
 
 		 295 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  57.49 
 
 		 287 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  56.16 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  56.16 
 
 		 294 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  55.82 
 
 		 294 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  56.16 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  56.16 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  55.82 
 
 		 294 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  55.82 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  55.82 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  55.48 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.21 
 
 		 287 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.21 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.21 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.21 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.21 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.21 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.21 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  52.49 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  54.01 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  55.76 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  55.52 
 
 		 294 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  53.08 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  53.08 
 
 		 294 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3306  inner-membrane translocator  57.45 
 
 		 295 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.605647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  53.08 
 
 		 294 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1399  inner-membrane translocator  53.31 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3517  inner-membrane translocator  54.45 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2952  inner-membrane translocator  57.39 
 
 		 291 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2867  inner-membrane translocator  55.75 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1438  inner-membrane translocator  54.36 
 
 		 293 aa  262  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.683973 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  50.68 
 
 		 656 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3289  hypothetical protein  54.86 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0960576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  53.42 
 
 		 296 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6726  inner-membrane translocator  55.27 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5820  inner-membrane translocator  55.27 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  51.39 
 
 		 294 aa  248  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5954  inner-membrane translocator  53.42 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00927263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.63 
 
 		 290 aa  244  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3530  inner-membrane translocator  55.4 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902092  normal  0.626427 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6268  inner-membrane translocator  51.81 
 
 		 294 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.770597  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3780  inner-membrane translocator  55.07 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1378  inner-membrane translocator  51.04 
 
 		 293 aa  235  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2931  inner-membrane translocator  52.8 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4078  inner-membrane translocator  56.79 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1078  inner-membrane translocator  54.36 
 
 		 294 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0299849  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0009  inner-membrane translocator  51.61 
 
 		 294 aa  228  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.30949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3484  inner-membrane translocator  53.26 
 
 		 291 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3118  inner-membrane translocator  53.05 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0009  inner-membrane translocator  48.5 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.978164  normal  0.0292693 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1676  inner-membrane translocator  53.66 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4076  inner-membrane translocator  54.35 
 
 		 294 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2464  inner-membrane translocator  53.42 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707029  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5161  inner-membrane translocator  53.08 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1284  inner-membrane translocator  53.05 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  42.16 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  43.94 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2138  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  55.9 
 
 		 288 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1819  inner-membrane translocator  55.9 
 
 		 288 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  41.81 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  45.55 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  42.25 
 
 		 285 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  41.38 
 
 		 291 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  44.01 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  40 
 
 		 291 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  40.42 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  44.36 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  40 
 
 		 652 aa  188  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  40 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  40.49 
 
 		 286 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  41.05 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 293 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4271  inner-membrane translocator  43.34 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>