More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1621 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  100 
 
 
287 aa  560  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  97.56 
 
 
287 aa  551  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  91.29 
 
 
287 aa  517  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  88.5 
 
 
287 aa  500  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  80.84 
 
 
313 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  66.08 
 
 
288 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  64.6 
 
 
293 aa  377  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  63.92 
 
 
315 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  64.51 
 
 
293 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  67.25 
 
 
288 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  65.73 
 
 
288 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  67.94 
 
 
288 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  67.6 
 
 
288 aa  349  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  63.86 
 
 
290 aa  346  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  61.81 
 
 
290 aa  341  7e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  56.1 
 
 
290 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  54.7 
 
 
290 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  56.94 
 
 
286 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  57.3 
 
 
286 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  50 
 
 
308 aa  265  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  46.53 
 
 
306 aa  254  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  50.85 
 
 
305 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  50.67 
 
 
306 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  52.01 
 
 
306 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  46.78 
 
 
305 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  46.15 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  48.34 
 
 
305 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  47.04 
 
 
306 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  48.28 
 
 
304 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  47.85 
 
 
306 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  47.75 
 
 
306 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  46.05 
 
 
306 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  48.47 
 
 
308 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  43.37 
 
 
286 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  47.28 
 
 
303 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  44.98 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  45.76 
 
 
304 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.35 
 
 
305 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  45.58 
 
 
306 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  47.12 
 
 
329 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0861  inner-membrane translocator  44.93 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220727  normal  0.159133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0635  inner-membrane translocator  43.39 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.75 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  42.51 
 
 
286 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  46.8 
 
 
306 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  40.94 
 
 
283 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4044  inner-membrane translocator  45.45 
 
 
304 aa  188  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  39.15 
 
 
652 aa  188  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.35 
 
 
290 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  40.57 
 
 
289 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  43.9 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  43.55 
 
 
296 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  40.99 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  41.61 
 
 
285 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  37.13 
 
 
297 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  39.86 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  37.59 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  40.78 
 
 
299 aa  178  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  40.84 
 
 
315 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  40.46 
 
 
330 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  40.77 
 
 
296 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  40.77 
 
 
296 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  39.66 
 
 
628 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  40.07 
 
 
286 aa  175  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  40.08 
 
 
330 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  39.01 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  40.99 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  40.99 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1178  inner-membrane translocator  37.86 
 
 
288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  39.13 
 
 
282 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  40.68 
 
 
323 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  40.43 
 
 
286 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  36.81 
 
 
288 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  37.02 
 
 
289 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  41.28 
 
 
300 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  40.07 
 
 
286 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  35.42 
 
 
288 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  40.28 
 
 
293 aa  168  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1400  inner-membrane translocator  39.54 
 
 
342 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704678  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2565  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.11 
 
 
286 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  36 
 
 
289 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  40.07 
 
 
291 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  36.97 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  41.61 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4168  inner-membrane translocator  41 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  40.14 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  37.8 
 
 
294 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
315 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  37.8 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  37.8 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 
311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  37.18 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  39.43 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  35.49 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  38.14 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0649  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  39.85 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.8 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>