More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1804 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  100 
 
 		 293 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  94.88 
 
 		 293 aa  517  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2582  inner-membrane translocator  67.7 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  57.19 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  49.32 
 
 		 301 aa  265  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1438  inner-membrane translocator  53.57 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.683973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  51.25 
 
 		 295 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  51.61 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  51.61 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  47.24 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  48.28 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  47.24 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  48.28 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  48.97 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  48.28 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  48.28 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  48.62 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.62 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  48.56 
 
 		 295 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  48.62 
 
 		 294 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  51.03 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  48.44 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.44 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  48.44 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  51.72 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  48.44 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  51.74 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  48.44 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  48.44 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  46.55 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.28 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  51.56 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.57 
 
 		 295 aa  247  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  51.79 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  48.01 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.57 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  46.9 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  50.36 
 
 		 295 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  47.2 
 
 		 656 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  46.21 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  50 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3517  inner-membrane translocator  46.21 
 
 		 294 aa  234  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2952  inner-membrane translocator  51.54 
 
 		 291 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3306  inner-membrane translocator  51.79 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.605647  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2867  inner-membrane translocator  49.65 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  47.84 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1399  inner-membrane translocator  46.53 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6726  inner-membrane translocator  48 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5820  inner-membrane translocator  48 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5954  inner-membrane translocator  46.9 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00927263  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2931  inner-membrane translocator  51.8 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3289  hypothetical protein  49.64 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0960576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3530  inner-membrane translocator  51.57 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902092  normal  0.626427 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6268  inner-membrane translocator  47.12 
 
 		 294 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.770597  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3780  inner-membrane translocator  48.19 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1378  inner-membrane translocator  48.03 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0009  inner-membrane translocator  47.6 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.978164  normal  0.0292693 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4078  inner-membrane translocator  51.57 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  44.91 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1676  inner-membrane translocator  52.07 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1078  inner-membrane translocator  50.35 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0299849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.1 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 652 aa  199  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  47.52 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0009  inner-membrane translocator  45.68 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.30949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3484  inner-membrane translocator  46.4 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  43.6 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  43.36 
 
 		 286 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  46.07 
 
 		 296 aa  195  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  41.79 
 
 		 283 aa  195  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  44.68 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  43.25 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  42.25 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  44.1 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3118  inner-membrane translocator  45.68 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2464  inner-membrane translocator  46.21 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707029  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5161  inner-membrane translocator  47.86 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4076  inner-membrane translocator  47.12 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2138  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  52.25 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1819  inner-membrane translocator  52.25 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  40.62 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  41.13 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1284  inner-membrane translocator  47.84 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 289 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  41.13 
 
 		 290 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  43.21 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>