More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4182 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  100 
 
 		 289 aa  550  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  45.26 
 
 		 652 aa  239  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  44.04 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.96 
 
 		 290 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  42.45 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  42.46 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  44.6 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  40.93 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  42.75 
 
 		 291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  41.34 
 
 		 287 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  44.53 
 
 		 296 aa  198  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.15 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 285 aa  195  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  43.62 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  40.57 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  44.84 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 286 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 628 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  40 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  43.26 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  39.51 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  43.6 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2565  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.91 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.56 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  41.05 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 290 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  39.79 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  41.24 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2867  inner-membrane translocator  44.01 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.34 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  41.2 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  40 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 		 294 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 286 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 295 aa  178  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  40.79 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  40.52 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.42 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  40.42 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  40.42 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  40.42 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  40.42 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  40.42 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 		 287 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6573  inner-membrane translocator  43.96 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0445304  hitchhiker  0.00930416 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  38.4 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.97 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3306  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 295 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.605647  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2582  inner-membrane translocator  48.36 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 295 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  38.16 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  42.07 
 
 		 628 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 330 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 345 aa  170  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  39.22 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>