More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6434 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  100 
 
 
295 aa  564  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  73.47 
 
 
320 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  73.47 
 
 
320 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  73.47 
 
 
294 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  73.47 
 
 
294 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  73.47 
 
 
294 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  73.47 
 
 
294 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  73.47 
 
 
294 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  73.13 
 
 
294 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  72.79 
 
 
294 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  73.47 
 
 
294 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  72.45 
 
 
294 aa  407  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  73.47 
 
 
294 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  72.79 
 
 
294 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  72.79 
 
 
294 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  72.11 
 
 
294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  72.79 
 
 
294 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  72.45 
 
 
294 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  71.43 
 
 
313 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  74.22 
 
 
287 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  71.43 
 
 
294 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  71.43 
 
 
294 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  71.77 
 
 
295 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3517  inner-membrane translocator  71.09 
 
 
294 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  71.43 
 
 
295 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  70.75 
 
 
295 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  71.82 
 
 
293 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  69.73 
 
 
296 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  75.27 
 
 
295 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  69.05 
 
 
295 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  69.39 
 
 
295 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5954  inner-membrane translocator  68.47 
 
 
295 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00927263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  68.94 
 
 
294 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  68.71 
 
 
295 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  68.37 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1399  inner-membrane translocator  68.37 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3780  inner-membrane translocator  71.67 
 
 
294 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  68.03 
 
 
295 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1438  inner-membrane translocator  69.15 
 
 
293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.683973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  68.17 
 
 
291 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6268  inner-membrane translocator  70.18 
 
 
294 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.770597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  67.82 
 
 
291 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2867  inner-membrane translocator  68.71 
 
 
295 aa  352  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  62.29 
 
 
301 aa  352  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  69.12 
 
 
287 aa  351  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  67.13 
 
 
291 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  67.13 
 
 
291 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3484  inner-membrane translocator  73.45 
 
 
291 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5161  inner-membrane translocator  72.11 
 
 
294 aa  342  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143386  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3306  inner-membrane translocator  67.8 
 
 
295 aa  341  8e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.605647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3118  inner-membrane translocator  72.73 
 
 
294 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210846  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3530  inner-membrane translocator  69.97 
 
 
294 aa  340  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902092  normal  0.626427 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3289  hypothetical protein  67.35 
 
 
295 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0960576  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1378  inner-membrane translocator  70.21 
 
 
293 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2464  inner-membrane translocator  70.75 
 
 
294 aa  338  9e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707029  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6726  inner-membrane translocator  68.71 
 
 
295 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5820  inner-membrane translocator  68.37 
 
 
295 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4076  inner-membrane translocator  72.36 
 
 
294 aa  328  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1078  inner-membrane translocator  69.28 
 
 
294 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0299849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2952  inner-membrane translocator  66.67 
 
 
291 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349553  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4078  inner-membrane translocator  69.62 
 
 
294 aa  325  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0009  inner-membrane translocator  65.36 
 
 
306 aa  323  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.978164  normal  0.0292693 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0009  inner-membrane translocator  70.55 
 
 
294 aa  320  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.30949  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  60.07 
 
 
656 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1284  inner-membrane translocator  72.73 
 
 
294 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115194  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1676  inner-membrane translocator  64.81 
 
 
287 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2931  inner-membrane translocator  63.14 
 
 
295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2138  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  66.43 
 
 
288 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1819  inner-membrane translocator  66.43 
 
 
288 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  56.45 
 
 
300 aa  259  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  48.45 
 
 
293 aa  255  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  48.57 
 
 
293 aa  245  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2582  inner-membrane translocator  56.32 
 
 
291 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  43.84 
 
 
299 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  44.29 
 
 
296 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  44.29 
 
 
296 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  41.26 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  44.29 
 
 
296 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  41.28 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  40.21 
 
 
291 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  40.22 
 
 
285 aa  188  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  43.93 
 
 
296 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  44.64 
 
 
296 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  39.13 
 
 
289 aa  185  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  38.41 
 
 
289 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  37.99 
 
 
285 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  39.62 
 
 
290 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  40.91 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
293 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  39.78 
 
 
286 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  39.7 
 
 
287 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
287 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  39.78 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  39.78 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  38.35 
 
 
283 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  36.13 
 
 
290 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  39.02 
 
 
289 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  35.85 
 
 
290 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>