More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8565 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  100 
 
 		 289 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  66.44 
 
 		 289 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  49.65 
 
 		 293 aa  238  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  46.9 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  46.13 
 
 		 291 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  46.21 
 
 		 291 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.96 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 652 aa  222  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  45.42 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  46.5 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 294 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.06 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  41.26 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.36 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.66 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.51 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.51 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.66 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.51 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.51 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.51 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.51 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  43.36 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  43.36 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  43.36 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.66 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4700  inner-membrane translocator  49.04 
 
 		 296 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365465  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  42.66 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  42.66 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  43.66 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  42.25 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  42.25 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  43.31 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  45.61 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  44.56 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2867  inner-membrane translocator  45.1 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  40 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  40.21 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  41.05 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  42.7 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1399  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3517  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  40.35 
 
 		 291 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3575  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 291 aa  188  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  43.53 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  44.21 
 
 		 286 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  38.32 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  40 
 
 		 294 aa  185  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  46.24 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1438  inner-membrane translocator  41.7 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.683973 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.54 
 
 		 656 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  40.35 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 291 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  43.88 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 293 aa  182  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  39.65 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6726  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5820  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6268  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.770597  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5954  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00927263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3306  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.605647  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  44.56 
 
 		 286 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  44.56 
 
 		 286 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3289  hypothetical protein  42.96 
 
 		 295 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0960576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  41.32 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1378  inner-membrane translocator  41.07 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2931  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 295 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3530  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902092  normal  0.626427 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.77 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3484  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 291 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0009  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.30949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3902  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  43.71 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83606  normal  0.194602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3780  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4078  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3830  inner-membrane translocator  44.72 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2565  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.66 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4907  inner-membrane translocator  44.72 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1676  inner-membrane translocator  40.42 
 
 		 287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 283 aa  165  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2952  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>