More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0499 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 286 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  45.99 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  38.72 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  40.23 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  37.64 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  39.05 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  40.15 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 652 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.71 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  36.2 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  36.92 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 305 aa  168  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2565  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.29 
 
 		 286 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  36.33 
 
 		 286 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6573  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0445304  hitchhiker  0.00930416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  34.74 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  38.13 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 329 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 628 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1013  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.361525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  36.33 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  36.33 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.33 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6574  inner-membrane translocator  41.01 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0310358  normal  0.0403201 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  37.55 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.23 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4108  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6091  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.754809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5727  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.923456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  35.23 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.96 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  39.3 
 
 		 628 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  34.59 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.94 
 
 		 294 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3830  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4907  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3725  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 294 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.23 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  41.15 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1901  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2867  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.957765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>