More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6573 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6573  inner-membrane translocator  100 
 
 		 286 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0445304  hitchhiker  0.00930416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2565  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  99.3 
 
 		 286 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  85.26 
 
 		 286 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6574  inner-membrane translocator  92.31 
 
 		 286 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0310358  normal  0.0403201 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5727  inner-membrane translocator  92.31 
 
 		 308 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.923456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6091  inner-membrane translocator  92.31 
 
 		 308 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.754809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  83.1 
 
 		 286 aa  437  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  79.58 
 
 		 285 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  84.97 
 
 		 286 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4907  inner-membrane translocator  83.1 
 
 		 285 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3830  inner-membrane translocator  83.1 
 
 		 285 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4271  inner-membrane translocator  67.14 
 
 		 314 aa  349  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  63.16 
 
 		 286 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  63.16 
 
 		 286 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  63.16 
 
 		 286 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  60.7 
 
 		 285 aa  322  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0758  inner-membrane translocator  65.72 
 
 		 284 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  44.21 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 652 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.7 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  46.95 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  41.46 
 
 		 287 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  42.91 
 
 		 289 aa  201  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  40.77 
 
 		 287 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  41.52 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  40.75 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 287 aa  195  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  42.29 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.29 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  41.52 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.65 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.86 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.57 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 291 aa  188  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  38.75 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.79 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  40.49 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 291 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  37.01 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3517  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 286 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 313 aa  181  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 291 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  37.55 
 
 		 291 aa  178  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  42.4 
 
 		 288 aa  178  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  40.57 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2867  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  44.96 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  40.77 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 290 aa  175  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  38.13 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>