More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3999 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  100 
 
 		 308 aa  587  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  77.05 
 
 		 306 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  69.41 
 
 		 305 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  71.8 
 
 		 306 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  57.62 
 
 		 305 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  55.41 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  56.95 
 
 		 306 aa  322  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  57.24 
 
 		 305 aa  311  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  56.29 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  56.16 
 
 		 306 aa  299  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  56.36 
 
 		 306 aa  298  8e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  56.38 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  55.15 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  51.68 
 
 		 287 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  53.95 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  55.48 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  50.67 
 
 		 287 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  50 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  52.17 
 
 		 306 aa  272  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  48.99 
 
 		 287 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  59.06 
 
 		 305 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  55.48 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  51.68 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  53.74 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 313 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  46.82 
 
 		 288 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  52.49 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4044  inner-membrane translocator  55.26 
 
 		 304 aa  250  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  46.62 
 
 		 290 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  48.16 
 
 		 288 aa  248  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0635  inner-membrane translocator  51.34 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  46.58 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0861  inner-membrane translocator  54.36 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220727  normal  0.159133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  45.6 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  46.25 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  44.33 
 
 		 286 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  48 
 
 		 290 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 288 aa  242  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  48.51 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  45.61 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  43.96 
 
 		 286 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  50.58 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  40.6 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.72 
 
 		 286 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  40.33 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 652 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.03 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  40 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 628 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  39.53 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 286 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 288 aa  175  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2565  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.2 
 
 		 286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  34.89 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  38.93 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  38.28 
 
 		 628 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3830  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4907  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6573  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0445304  hitchhiker  0.00930416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5727  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.923456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6091  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.754809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  39.47 
 
 		 292 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1901  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6574  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0310358  normal  0.0403201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  33.88 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4168  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 315 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1753  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  41.31 
 
 		 626 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  40 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.55 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>