More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4400 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  100 
 
 
304 aa  579  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  58 
 
 
305 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  56 
 
 
306 aa  311  9e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  54.73 
 
 
306 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  54.85 
 
 
305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  55.21 
 
 
306 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  56.1 
 
 
304 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  58 
 
 
308 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  55.48 
 
 
308 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  53.18 
 
 
306 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  61.74 
 
 
306 aa  281  9e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  54.03 
 
 
306 aa  278  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  58.39 
 
 
303 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  50.69 
 
 
306 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0861  inner-membrane translocator  59.4 
 
 
305 aa  261  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220727  normal  0.159133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  48.48 
 
 
288 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  53.49 
 
 
306 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  51.16 
 
 
305 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  52.35 
 
 
306 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  59.14 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  52.17 
 
 
329 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  52.16 
 
 
306 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  46.13 
 
 
287 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0635  inner-membrane translocator  49.33 
 
 
306 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  47.1 
 
 
290 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  45.76 
 
 
287 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  45.42 
 
 
287 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  47.81 
 
 
288 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  46.42 
 
 
290 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  48.16 
 
 
306 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  45.03 
 
 
315 aa  238  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  46.03 
 
 
293 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  44.07 
 
 
287 aa  235  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  43.83 
 
 
293 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4044  inner-membrane translocator  53.31 
 
 
304 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  47.62 
 
 
290 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  46 
 
 
286 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  47.28 
 
 
290 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  48.15 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  45.67 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  45.92 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  44.44 
 
 
288 aa  218  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  46.88 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  39 
 
 
286 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  40.13 
 
 
652 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  39.2 
 
 
286 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.41 
 
 
286 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  38.78 
 
 
297 aa  175  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  38.23 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  37.94 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  38.97 
 
 
289 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  39.84 
 
 
283 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  38.26 
 
 
317 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  37.67 
 
 
288 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6070  inner-membrane translocator  35.45 
 
 
286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  36.57 
 
 
315 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  40.98 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  38.63 
 
 
289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  36.12 
 
 
286 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  38.44 
 
 
628 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  36.67 
 
 
296 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  36.67 
 
 
296 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
285 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 
311 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  36.22 
 
 
315 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  36.13 
 
 
315 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  39.87 
 
 
291 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  36.51 
 
 
330 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  35.41 
 
 
336 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4168  inner-membrane translocator  36.57 
 
 
315 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  36.51 
 
 
330 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  36.03 
 
 
282 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  38.44 
 
 
286 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1901  inner-membrane translocator  39.67 
 
 
311 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  36.67 
 
 
296 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  35.28 
 
 
315 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  36.5 
 
 
286 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 
286 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.5 
 
 
286 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  36.12 
 
 
286 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.58 
 
 
294 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  36.58 
 
 
294 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  34.11 
 
 
313 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  35.86 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 
295 aa  153  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  36.91 
 
 
294 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  37.42 
 
 
320 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4108  inner-membrane translocator  42.49 
 
 
283 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.58 
 
 
294 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  33.02 
 
 
345 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.74 
 
 
295 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  37.42 
 
 
320 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  37.42 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3134  inner-membrane translocator  36.44 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0428472  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  36.45 
 
 
642 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  36.91 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  36.91 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 
287 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2760  inner-membrane translocator  36.07 
 
 
335 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>