More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3829 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  100 
 
 		 306 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  70.82 
 
 		 306 aa  355  5.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  59.48 
 
 		 306 aa  338  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  65.29 
 
 		 306 aa  338  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  64.09 
 
 		 306 aa  338  7e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  59.41 
 
 		 305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0635  inner-membrane translocator  64.05 
 
 		 306 aa  324  9e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  60.78 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  55.41 
 
 		 305 aa  305  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  56.38 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  57.24 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  55.59 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  58.64 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  54.14 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  53.2 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  53.47 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  55.37 
 
 		 306 aa  265  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4044  inner-membrane translocator  59.33 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  54.03 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  48.18 
 
 		 287 aa  258  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  53.77 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  47.85 
 
 		 287 aa  255  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  55.03 
 
 		 306 aa  254  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  54.18 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  47.52 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  47.85 
 
 		 287 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0861  inner-membrane translocator  55.96 
 
 		 305 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220727  normal  0.159133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  57.62 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  49.01 
 
 		 313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  43.42 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  43.28 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  46.26 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  43.28 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  45.15 
 
 		 286 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  46.36 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  45.1 
 
 		 290 aa  211  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  43.24 
 
 		 288 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  47.84 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  39.12 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.07 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 628 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  37.8 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 652 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 		 290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.19 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  38.58 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.19 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  38.19 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  39.04 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  39.81 
 
 		 628 aa  158  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  39.04 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  38.25 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4700  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365465  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3967  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.45 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0703  inner-membrane translocator  43.25 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0248048  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  42.97 
 
 		 642 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4168  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  36.86 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.59 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1901  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1178  inner-membrane translocator  38.74 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1934  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.91 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1013  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.361525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 626 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2013  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.19 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>