More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1751 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  100 
 
 		 315 aa  607  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  97.13 
 
 		 330 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  97.13 
 
 		 330 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  84.03 
 
 		 323 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1400  inner-membrane translocator  84.08 
 
 		 342 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704678  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  73.65 
 
 		 315 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2024  inner-membrane translocator  72.61 
 
 		 317 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.266794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1680  inner-membrane translocator  72.61 
 
 		 317 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2933  inner-membrane translocator  71.66 
 
 		 317 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0799097  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  62.54 
 
 		 317 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3309  inner-membrane translocator  72.2 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322821  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  62.46 
 
 		 315 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  62.46 
 
 		 315 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2929  inner-membrane translocator  71.57 
 
 		 317 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4168  inner-membrane translocator  61.83 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  63.17 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1796  inner-membrane translocator  71.79 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2577  inner-membrane translocator  72.38 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  60.88 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1838  inner-membrane translocator  69.84 
 
 		 317 aa  359  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.116959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  57.64 
 
 		 311 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1771  putative amino acid transmembrane protein  63.82 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0263135 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1438  ABC transporter, permease protein  57.96 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1850  inner-membrane translocator  60.82 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1649  ABC transporter, permease protein  58.6 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0890967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1671  branched chain amino acid ABC transporter permease  58.6 
 
 		 311 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0907  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  58.6 
 
 		 311 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0442  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  58.6 
 
 		 311 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0720  ABC transporter, permease protein  58.6 
 
 		 311 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1825  putative branched amino acid transport system, membrane protein  58.6 
 
 		 311 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582047  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2818  inner-membrane translocator  60.95 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.133743 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1333  inner-membrane translocator  57.96 
 
 		 312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0102274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1901  inner-membrane translocator  56.23 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1294  inner-membrane translocator  58.58 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0932  inner-membrane translocator  57.51 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1414  inner-membrane translocator  57.51 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1318  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  60.32 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1607  inner-membrane translocator  59.68 
 
 		 316 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4558  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  57.83 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0025  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  53.5 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1392  inner-membrane translocator  57.83 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1574  inner-membrane translocator  53.63 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  41.38 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  40.84 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 290 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  41.91 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 290 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 293 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  41.08 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  40.27 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  37.55 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 		 295 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 330 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 295 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.55 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  38.82 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  37.98 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2421  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719223  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>