More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1796 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1796  inner-membrane translocator  100 
 
 		 317 aa  607  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2933  inner-membrane translocator  88.25 
 
 		 317 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0799097  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2024  inner-membrane translocator  87.62 
 
 		 317 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.266794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1680  inner-membrane translocator  87.62 
 
 		 317 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2929  inner-membrane translocator  84.13 
 
 		 317 aa  451  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3309  inner-membrane translocator  83.81 
 
 		 317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322821  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  76.92 
 
 		 315 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1838  inner-membrane translocator  74.6 
 
 		 317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.116959 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  71.2 
 
 		 330 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  71.2 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  71.79 
 
 		 315 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2577  inner-membrane translocator  77.24 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  68.79 
 
 		 323 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1400  inner-membrane translocator  70.7 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  58.97 
 
 		 315 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  57.64 
 
 		 317 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  58.33 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4168  inner-membrane translocator  58.65 
 
 		 315 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  57.37 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1771  putative amino acid transmembrane protein  67.36 
 
 		 340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0263135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  58.47 
 
 		 317 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1850  inner-membrane translocator  60.37 
 
 		 343 aa  302  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1438  ABC transporter, permease protein  52.87 
 
 		 308 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  53.18 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1649  ABC transporter, permease protein  53.82 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0890967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0442  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  54.34 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0907  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  54.34 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0720  ABC transporter, permease protein  54.34 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1671  branched chain amino acid ABC transporter permease  54.34 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1825  putative branched amino acid transport system, membrane protein  54.34 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582047  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0025  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  54.07 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2818  inner-membrane translocator  57.05 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.133743 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1901  inner-membrane translocator  53.21 
 
 		 311 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1333  inner-membrane translocator  53.35 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0102274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1294  inner-membrane translocator  53.35 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0932  inner-membrane translocator  53.21 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1414  inner-membrane translocator  53.21 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1574  inner-membrane translocator  52.56 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1607  inner-membrane translocator  57.42 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1318  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.41 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4558  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  53.21 
 
 		 311 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1392  inner-membrane translocator  53.21 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 287 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  38.99 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  37.03 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 305 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 293 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 286 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 306 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 291 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 652 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  37.03 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  34.49 
 
 		 286 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 628 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  39.23 
 
 		 642 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  34.81 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  34.81 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.81 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.18 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>