More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1242 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  100 
 
 		 628 aa  1188    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  89.98 
 
 		 626 aa  907    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  54.15 
 
 		 637 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  55.95 
 
 		 630 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  55.27 
 
 		 642 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  53.44 
 
 		 633 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  52.94 
 
 		 628 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  53.16 
 
 		 646 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  52.84 
 
 		 646 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  53.81 
 
 		 655 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  53.83 
 
 		 635 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  53.22 
 
 		 632 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0859  inner-membrane translocator  54.89 
 
 		 629 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0584  inner-membrane translocator  52.48 
 
 		 613 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  44.04 
 
 		 623 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  44.39 
 
 		 622 aa  379  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 652 aa  293  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.91 
 
 		 656 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  44.68 
 
 		 297 aa  207  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 286 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  43.06 
 
 		 286 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  41.58 
 
 		 286 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 289 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  43.99 
 
 		 292 aa  180  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 285 aa  179  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 293 aa  178  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 299 aa  178  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 287 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 306 aa  177  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 287 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 286 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 287 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  40 
 
 		 308 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 286 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 286 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  36.71 
 
 		 838 aa  173  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 315 aa  172  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 286 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  40.68 
 
 		 287 aa  172  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  39.68 
 
 		 333 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 286 aa  170  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.27 
 
 		 603 aa  170  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  43 
 
 		 300 aa  169  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 286 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 290 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 293 aa  167  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 313 aa  166  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 288 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.89 
 
 		 285 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 289 aa  165  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  39.68 
 
 		 306 aa  165  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 358 aa  164  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4271  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 314 aa  163  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 306 aa  162  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 286 aa  162  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 282 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 603 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 290 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 332 aa  160  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  32 
 
 		 603 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  38.77 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  41.29 
 
 		 305 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 351 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 305 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  41.07 
 
 		 319 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  40 
 
 		 305 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  31.84 
 
 		 603 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 603 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 288 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3321  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 293 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 304 aa  156  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 339 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 339 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.07 
 
 		 286 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4906  inner-membrane translocator  41.32 
 
 		 322 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3829  inner-membrane translocator  41.32 
 
 		 322 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 291 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  35.67 
 
 		 852 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 315 aa  155  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  39.12 
 
 		 286 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 293 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 306 aa  154  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 353 aa  153  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.13 
 
 		 355 aa  154  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 288 aa  153  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  41.06 
 
 		 296 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  41.06 
 
 		 296 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 294 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 290 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 288 aa  152  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 294 aa  151  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 289 aa  150  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 290 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 294 aa  150  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 294 aa  150  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 320 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>