More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1574 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1574  inner-membrane translocator  100 
 
 		 313 aa  589  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0025  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  74.44 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  54.78 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  53.63 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  53.35 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  53.35 
 
 		 330 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  49.53 
 
 		 317 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  48.88 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  49.23 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  52.08 
 
 		 323 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2933  inner-membrane translocator  51.91 
 
 		 317 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0799097  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2024  inner-membrane translocator  51.91 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.266794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1680  inner-membrane translocator  51.91 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  47.28 
 
 		 315 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4168  inner-membrane translocator  47.6 
 
 		 315 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  47.92 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3309  inner-membrane translocator  53.35 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322821  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1400  inner-membrane translocator  51.76 
 
 		 342 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1796  inner-membrane translocator  52.56 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2929  inner-membrane translocator  52.4 
 
 		 317 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2577  inner-membrane translocator  52.87 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.57 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1838  inner-membrane translocator  51.27 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.116959 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1438  ABC transporter, permease protein  49.21 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1649  ABC transporter, permease protein  49.52 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0890967  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0907  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  49.21 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0442  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  49.21 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0720  ABC transporter, permease protein  49.21 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1671  branched chain amino acid ABC transporter permease  49.52 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1825  putative branched amino acid transport system, membrane protein  49.21 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582047  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1850  inner-membrane translocator  47.22 
 
 		 343 aa  219  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1771  putative amino acid transmembrane protein  49.26 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0263135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2818  inner-membrane translocator  48.73 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.133743 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1333  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0102274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1294  inner-membrane translocator  46.52 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1318  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  48.73 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1901  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 311 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4558  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  46.03 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0932  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1414  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  39.42 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  41.9 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1392  inner-membrane translocator  45.86 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1607  inner-membrane translocator  46.35 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 289 aa  165  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 286 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  40 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  40 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 295 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 652 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  31.85 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  32.68 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.29 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>