More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A1934 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A1934  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
286 aa  541  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3408  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.65 
 
 
286 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000427982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  96.85 
 
 
286 aa  532  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  97.55 
 
 
286 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  97.2 
 
 
286 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  97.2 
 
 
286 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  97.2 
 
 
286 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  96.5 
 
 
286 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2013  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  96.85 
 
 
286 aa  487  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2034  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  96.48 
 
 
284 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.191012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  42.61 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  40.34 
 
 
353 aa  208  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4885  inner-membrane translocator  43.45 
 
 
341 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  40.34 
 
 
330 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 
336 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4059  inner-membrane translocator  42.27 
 
 
336 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372426  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2421  inner-membrane translocator  39.31 
 
 
327 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1371  inner-membrane translocator  40.69 
 
 
336 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0328  inner-membrane translocator  40.69 
 
 
327 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.59084  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1983  inner-membrane translocator  39.39 
 
 
341 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  37.14 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  42.91 
 
 
299 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  36.69 
 
 
290 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38.63 
 
 
287 aa  178  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  37.59 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  38.41 
 
 
286 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  37.77 
 
 
286 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  37.72 
 
 
652 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0420  inner-membrane translocator  40.69 
 
 
288 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  39.64 
 
 
290 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  36.43 
 
 
286 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  38.71 
 
 
290 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  37.32 
 
 
287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  36.97 
 
 
287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.25 
 
 
290 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  40.91 
 
 
286 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  38.87 
 
 
293 aa  162  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  37.31 
 
 
305 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.99 
 
 
286 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  37.25 
 
 
308 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  40.79 
 
 
285 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  39.76 
 
 
305 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  39.39 
 
 
306 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  36.5 
 
 
288 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  37.85 
 
 
305 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  35.21 
 
 
286 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  38.43 
 
 
297 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
315 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  36.19 
 
 
306 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  34.05 
 
 
293 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  37.23 
 
 
288 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  38.27 
 
 
291 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  37.99 
 
 
288 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  38.85 
 
 
296 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  38.58 
 
 
306 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  38.85 
 
 
296 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.68 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  36.18 
 
 
306 aa  152  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  35.56 
 
 
313 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  40.84 
 
 
306 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 
336 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0041  inner-membrane translocator  40.15 
 
 
299 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00123525  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  34.87 
 
 
306 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1753  inner-membrane translocator  39.02 
 
 
291 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3802  inner-membrane translocator  39.47 
 
 
315 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  37.32 
 
 
289 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3913  inner-membrane translocator  40.21 
 
 
292 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.188652  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  37.89 
 
 
296 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  35.05 
 
 
304 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0077  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  40.15 
 
 
298 aa  149  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  32.97 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  36.52 
 
 
291 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  35.53 
 
 
317 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  35.23 
 
 
289 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  39.69 
 
 
306 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
288 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  33.2 
 
 
306 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  38.85 
 
 
296 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  35.79 
 
 
628 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  40.54 
 
 
286 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  34.4 
 
 
283 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  37.15 
 
 
289 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  38.46 
 
 
296 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 
311 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  36.19 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  35.08 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  39.24 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  38.95 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  39.72 
 
 
286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  34.28 
 
 
317 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  35.11 
 
 
291 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4700  inner-membrane translocator  37.84 
 
 
296 aa  138  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365465  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  40.38 
 
 
306 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  36.07 
 
 
315 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  35.74 
 
 
315 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4107  inner-membrane translocator  41.52 
 
 
519 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.758696  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  35.39 
 
 
345 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  36.75 
 
 
291 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  36.47 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>