More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0041 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0041  inner-membrane translocator  100 
 
 		 299 aa  567  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00123525  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0077  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  83.28 
 
 		 298 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3913  inner-membrane translocator  59.52 
 
 		 292 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.188652  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0420  inner-membrane translocator  56.08 
 
 		 288 aa  269  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7909  inner-membrane translocator  64.18 
 
 		 291 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  37.88 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  38.57 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 652 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.18 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  38.18 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3802  inner-membrane translocator  42.42 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2421  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719223  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1983  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4885  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1934  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.23 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3408  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.23 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000427982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0328  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.59084  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2013  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.88 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  39.18 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2034  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.191012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4059  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372426  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 524 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 524 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  39.55 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1371  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  41.7 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.45 
 
 		 528 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.91 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 534 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  39.93 
 
 		 628 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 526 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  33.68 
 
 		 542 aa  138  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 628 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 551 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.56 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 637 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 527 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  35.98 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  34.26 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 526 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.43 
 
 		 551 aa  132  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.91 
 
 		 515 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.79 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0221  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.03 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.31 
 
 		 523 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.86 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 290 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 306 aa  128  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.03 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 630 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  39 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0565  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  40 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.7 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4107  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 519 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.758696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2176  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 340 aa  125  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.817413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>