More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2062 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  100 
 
 		 353 aa  677    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  91.39 
 
 		 330 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2421  inner-membrane translocator  83.38 
 
 		 327 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719223  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0328  inner-membrane translocator  84.42 
 
 		 327 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.59084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4885  inner-membrane translocator  61.37 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1983  inner-membrane translocator  69.47 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60.93 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  61.72 
 
 		 339 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4059  inner-membrane translocator  60.12 
 
 		 336 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372426  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1371  inner-membrane translocator  63.37 
 
 		 336 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  40.69 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  40.69 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.69 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  40.69 
 
 		 286 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 286 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2013  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2034  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.191012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1934  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.34 
 
 		 286 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3408  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.34 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000427982 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 287 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 652 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 287 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 628 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0420  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 		 290 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3913  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 292 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.188652  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0077  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  39.13 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  36.43 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3802  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  35.37 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0041  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00123525  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 305 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  35 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 306 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 306 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 288 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 288 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2176  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.817413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.46 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 290 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 286 aa  133  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.52 
 
 		 537 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 291 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1400  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 342 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 289 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 524 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2565  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.27 
 
 		 286 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 542 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>